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Enregistrement W2791252886 · doi:10.3389/fmicb.2018.00132

Genotypic and Phenotypic Diversity of Cryptococcus gattii VGII Clinical Isolates and Its Impact on Virulence

2018· article· en· W2791252886 sur OpenAlexaboutno aff
Vanessa Abreu Barcellos, Liline Maria Soares Martins, Alide Caroline Lima Fontes, Júlia Catarina Vieira Reuwsaat, Eamim Daidrê Squizani, Glauber Ribeiro de Sousa Araújo, Susana Frasés, Charley Christian Staats, Augusto Schrank, Lívia Kmetzsch, Marilene Henning Vainstein

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Mots-clésVirulenceCryptococcus gattiiBiologyGenotypePhenotypeDiversity (politics)MicrobiologyCryptococcosisGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Cryptococcus gattii species complex harbors the main etiological agents of cryptococcosis in immunocompetent patients. C. gattii molecular type VGII predominates in the north and northeastern regions of Brazil, leading to high morbidity and mortality rates. C. gattii VGII isolates have a strong clinical relevance and phenotypic variations. These phenotypic variations among C. gattii species complex isolates suggest that some strains are more virulent than others, but little information is available related to the pathogenic properties of those strains. In this study, we analyzed some virulence determinants of C. gattii VGII strains (CG01, CG02 and CG03) isolated from patients in the state of Piauí, Brazil. The C. gattii R265 VGIIa strain, which was isolated from the Vancouver outbreak, differed from C. gattii CG01, CG02 and CG03 isolates (also classified as VGII) when analyzed the capsular dimensions, melanin production, urease activity, as well as the glucuronoxylomannan (GXM) secretion. Those differences directly reflected in their virulence potential. In addition, CG02 displayed higher virulence compared to R265 (VGIIa) strain in a cryptococcal murine model of infection. Lastly, we examined the genotypic diversity of these strains through Multilocus Sequence Type (MLST) and one new subtype was described for the CG02 isolate. This study confirms the presence and the phenotypic and genotypic diversity of highly virulent strains in the Northeast region of Brazil.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,353

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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