<i>NUP98‐BPTF</i> gene fusion identified in primary refractory acute megakaryoblastic leukemia of infancy
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The advent of large scale genomic sequencing technologies significantly improved the molecular classification of acute megakaryoblastic leukaemia (AMKL). AMKL represents a subset (∼10%) of high fatality pediatric acute myeloid leukemia (AML). Recurrent and mutually exclusive chimeric gene fusions associated with pediatric AMKL are found in 60%‐70% of cases and include RBM15‐MKL1 , CBFA2T3‐GLIS2 , NUP98‐KDM5A and MLL rearrangements. In addition, another 4% of AMKL harbor NUP98 rearrangements ( NUP98 r), with yet undetermined fusion partners. We report a novel NUP98‐BPTF fusion in an infant presenting with primary refractory AMKL. In this NUP98 r, the C‐terminal chromatin recognition modules of BPTF, a core subunit of the NURF (nucleosome remodeling factor) ATP‐dependent chromatin‐remodeling complex, are fused to the N‐terminal moiety of NUP98, creating an in frame NUP98‐BPTF fusion, with structural homology to NUP98‐KDM5A. The leukemic blasts expressed two NUP98‐BPTF splicing variants, containing one or two tandemly spaced PHD chromatin reader domains. Our study also identified an unreported wild type BPTF splicing variant encoding for 2 PHD domains, detected both in normal cord blood CD34 + cells and in leukemic blasts, as with the fly BPTF homolog, Nurf301. Disease course was marked by rapid progression and primary chemoresistance, with ultimately significant tumor burden reduction following treatment with a clofarabine containing regimen. In sum, we report 2 novel NUP98‐BPTF fusion isoforms that contribute to refine the NUP98 r subgroup of pediatric AMKL. Multicenter clinical trials are critically required to determine the frequency of this fusion in AMKL patients and explore innovative treatment strategies for a disease still plagued with poor outcomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».