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Enregistrement W2791384942 · doi:10.1186/s13068-018-1074-3

A novel acetyl xylan esterase enabling complete deacetylation of substituted xylans

2018· article· en· W2791384942 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBiotechnology for Biofuels · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Toronto
Mots-clésXylanAcetylationEsteraseChemistryBiofuelBioenergyBiochemistryBiotechnologyPulp and paper industryHydrolysisEnzymeBiologyEngineeringGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acetylated 4- O -(methyl)glucuronoxylan (GX) is the main hemicellulose in deciduous hardwood, and comprises a β-(1→4)-linked xylopyranosyl (Xyl p ) backbone substituted by both acetyl groups and α-(1→2)-linked 4- O -methylglucopyranosyluronic acid (MeGlc p A). Whereas enzymes that target singly acetylated Xyl p or doubly 2,3- O -acetyl-Xyl p have been well characterized, those targeting (2- O -MeGlc p A)3- O -acetyl-Xyl p structures in glucuronoxylan have remained elusive. An unclassified carbohydrate esterase (FjoAcXE) was identified as a protein of unknown function from a polysaccharide utilization locus (PUL) otherwise comprising carbohydrate-active enzyme families known to target xylan. FjoAcXE was shown to efficiently release acetyl groups from internal (2- O -MeGlc p A)3- O -acetyl-Xyl p structures, an activity that has been sought after but lacking in known carbohydrate esterases. FjoAcXE action boosted the activity of α-glucuronidases from families GH67 and GH115 by five and nine times, respectively. Moreover, FjoAcXE activity was not only restricted to GX, but also deacetylated (3- O -Ara f )2- O -acetyl-Xyl p of feruloylated xylooligomers, confirming the broad substrate range of this new carbohydrate esterase. This study reports the discovery and characterization of the novel carbohydrate esterase, FjoAcXE. In addition to cleaving singly acetylated Xyl p , and doubly 2,3- O -acetyl-Xyl p , FjoAcXE efficiently cleaves internal 3- O -acetyl-Xyl p linkages in (2- O -MeGlc p A)3- O -acetyl-Xyl p residues along with densely substituted and branched xylooligomers; activities that until now were missing from the arsenal of enzymes required for xylan conversion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,104
Score d'incertitude au seuil0,687

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle