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Enregistrement W2791415117 · doi:10.7287/peerj.preprints.26627v1

Functional diversity and biogeography using ‘sFDvent’ - the first global trait database for hydrothermal vent species

2018· preprint· en· W2791415117 sur OpenAlexaff
Abbie S. A. Chapman, Amanda E. Bates, Verena Tunnicliffe, The sFDvent Working Group

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine Biology and Ecology Research
Établissements canadiensUniversity of VictoriaMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHydrothermal ventBiodiversityBiogeographyTraitEcologyEcosystemBiologyFunctional ecologySpatial ecologyDatabaseGeographyPaleontologyHydrothermal circulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The taxonomic composition of hydrothermal vent communities differs markedly on a global scale, forming distinct biogeographic provinces. The relative biodiversity of these areas can be assessed using traits as a common, cross-province ‘currency’. First, we used well-studied Juan de Fuca Ridge vents (NE Pacific) to assess trait data availability for vent species and to test the performance of functional diversity metrics given a species-poor system. These investigations highlighted vents as model ‘untouched’ ecosystems for developing ecological theory for conservation, advocating the potential of a vent trait database. Next, we built a global trait database for vent species – ‘sFDvent’. We selected traits that characterized the performance of a species and its contribution to ecosystem function, and best matched with established trait databases to ensure cross-ecosystem consistency. An international pool of experts scored these traits to populate the 14-trait database. Using sFDvent, we: created the first map of functional biogeography for deep-sea hydrothermal vents; assessed global-scale functional biodiversity trends (e.g., the East Pacific has fewer functionally unique species than the West Pacific, based on preliminary analyses); and evaluated the potential roles of large-scale environmental processes on these patterns.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0100,006
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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