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Enregistrement W2791467603 · doi:10.1158/1535-7163.mct-17-1091

Impact of Chemical-Induced Mutational Load Increase on Immune Checkpoint Therapy in Poorly Responsive Murine Tumors

2018· article· en· W2791467603 sur OpenAlexafffund
Elizabeth A. Kuczynski, Janna Krueger, Annabelle Chow, Ping Xu, Shan Man, Yogi Sundaravadanam, Jessica K. Miller, Paul M. Krzyzanowski, Robert S. Kerbel

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Therapeutics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer ResearchSunnybrook HospitalSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Cancer SocietyGovernment of Canada
Mots-clésImmune checkpointCancer researchCisplatinCD8Immune systemBiologyIn vivoCancerCytotoxic T cellImmunologyImmunotherapyChemotherapyGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A recurring historic finding in cancer drug development is encouraging antitumor effects observed in tumor-bearing mice that fail to translate into the clinic. An intriguing exception to this pattern is immune checkpoint therapy, as the sustained tumor regressions observed in subsets of cancer patients are rare in mice. Reasoning that this may be due in part to relatively low mutational loads of mouse tumors, we mutagenized transplantable mouse tumor cell lines EMT-6/P, B16F1, RENCA, CT26, and MC38 in vitro with methylnitro-nitrosoguanidine (MNNG) or ethylmethane sulfonate (EMS) and tested their responsiveness to PD-L1 blockade. Exome sequencing confirmed an increase in somatic mutations by mutagen treatment, an effect mimicked in EMT-6 variants chronically exposed in vivo to cisplatin or cyclophosphamide. Certain mutagenized variants of B16F1, EMT-6/P, CT26, and MC38 (but not RENCA) were more immunogenic than their parents, yet anti-PD-L1 sensitization developed only in some EMT-6/P and B16F1 variants. Treatment response patterns corresponded with changes in immune cell infiltration and especially increases in CD8+ T cells. Chronically cisplatin-exposed EMT-6 variants were also more responsive to anti-PD-L1 therapy. Although tumor PD-L1 expression was upregulated in in vivo chemotherapy-exposed variants, PD-L1 expression levels were not consistently associated with anti-PD-L1 treatment activity across mutagenized or chemotherapy-exposed variants. In summary, mutagenized and more immunogenic mouse tumors were not universally sensitized to PD-L1 blockade. Chemically mutagenized variants may be useful to evaluate the impact of immunologically “hot” or “cold” tumors with a high mutational load, to which certain chemotherapy agents may contribute, on immunotherapy outcomes. Mol Cancer Ther; 17(4); 869–82. ©2018 AACR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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