MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2791470404 · doi:10.1093/jcag/gwy008.254

A253 MEASUREMENT OF NATURAL KILLER CELL ACTIVITY (NKA) IN SUBJECTS UNDERGOING COLONOSCOPY:TEST PERFORMANCE OF A NEW BLOOD TEST AT DIFFERENT CUT-OFFS FOR THE DETECTION OF COLORECTAL CANCER (CRC)

2018· article· en· W2791470404 sur OpenAlexaff
Mathieu Provençal, Louis-Charles Rioux, Gilles Jobin, Benabdellatif Katia, Roberto Rodrı́guez-Suárez

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineColonoscopyColorectal cancerInternal medicineGastroenterologyCancerBlood testArea under the curveReceiver operating characteristicOncology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Low NKA has been linked to a higher risk of cancer and has been reported in CRC patients.A novel simple blood test in vitro diagnostic device (IVDD) which measures NKA in a small volume of whole blood is now available. Tha aim of the study is to evaluate the test performance metrics of the IVDD at different cut-offs in subjects with CRC and adenomatous polyps (AP). This study measured NKA in 1081 subjects presenting for screening or prescribed colonoscopies using a biological assay performed as per the manufacturer’s directions. In the 872 evaluable subjects,statistically significant differences were found between the NKA of subjects positive for CRC (n=23), and that of subjects negative for CRC (n=849) [CRC mean 317.1 pg/ml (DS:845.5),CRC-negative mean 745.7 pg/ml (SD:1028.5),p=0.001; CRC median 86.0 pg/ml (IQR:43.3–151.0),CRC-negative median 298.1 pg/ml (IQR:100.4–920.2),p<0.001]. The prevalence of CRC was 2.6% and of AP >10 mm was 14.6%. Receiver Operator Characterisitcs (ROC) analysis show an optimum cut-off for detection of CRC at 181 pg/ml,with an area under the curve of 73% (p<0.0001). At cut-offs of 200 pg/ml, high sensitivity and negative predictive values for detection of CRC were seen. At cut-offs of 300 and 500 pg/ml, a slight improvement in the test performance was seen in the sensitivity for AP>10 mm. The odds ratio for the NKA IVDD for the detection of cancer at a cut-off of 200 pg/ml was 10.3 (95% CI 3.03–34.9). The clinical results in the present study using new simple blood test for measurement of NKA confirm that there are limited benefits of using different cut-offs other than the optimal cut-off (220 pg/ml) for this new IVDD as determined by ROC analysis for detection of CRC None

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the Canadian Association of GastroenterologyMême sujetImmune Cell Function and InteractionTravaux en français237 207