Host gene expression profiles in ferrets infected with genetically distinct henipavirus strains
Notice bibliographique
Résumé
Henipavirus infection causes severe respiratory and neurological disease in humans that can be fatal.To characterize the pathogenic mechanisms of henipavirus infection in vivo, we performed experimental infections in ferrets followed by genome-wide gene expression analysis of lung and brain tissues.The Hendra, Nipah-Bangladesh, and Nipah-Malaysia strains caused severe respiratory and neurological disease with animals succumbing around 7 days post infection.Despite the presence of abundant viral shedding, animal-toanimal transmission did not occur.The host gene expression profiles of the lung tissue showed early activation of interferon responses and subsequent expression of inflammation-related genes that coincided with the clinical deterioration.Additionally, the lung tissue showed unchanged levels of lymphocyte markers and progressive downregulation of cell cycle genes and extracellular matrix components.Infection in the brain resulted in a limited breadth of the host responses, which is in accordance with the immunoprivileged status of this organ.Finally, we propose a model of the pathogenic mechanisms of henipavirus infection that integrates multiple components of the host responses. Author summaryHenipavirus infection can cause severe and often lethal respiratory and neurological disease in humans.The mechanisms by which these viruses cause disease are unknown.To characterize the mechanisms of henipavirus disease in vivo, we performed experimental infections in ferrets followed by characterization of the host response in lung and brain
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».