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Enregistrement W2791591931 · doi:10.1186/s13750-018-0118-2

What are the effective solutions to control the dissemination of antibiotic resistance in the environment? A systematic review protocol

2018· review· en· W2791591931 sur OpenAlexfundno aff
Anaïs Goulas, Barbara Livoreil, Nathalie Grall, Pierre Benoît, Céline Couderc-Obert, Christophe Dagot, Fabienne Petit, Cédric Laouenan, Antoine Andremont

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Evidence · 2018
Typereview
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePharmaceutical and Antibiotic Environmental Impacts
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaInstitut National de la Recherche AgronomiqueCentre National de la Recherche Scientifique
Mots-clésProtocol (science)Critical appraisalAntibioticsAntibiotic resistanceResistance (ecology)WildlifeGrey literatureQuality (philosophy)BiotechnologyEnvironmental resource managementMedicineMEDLINEBiologyEcologyEnvironmental scienceMicrobiologyAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Antibiotic treatments are indispensable for human and animal health. However, the heavy usage of antibiotics has led to the emergence of resistance. Antibiotic residues, antibiotic-resistant bacteria and genes are introduced into the terrestrial and aquatic environments via application of human and animal wastes. The emergence and the spread of antibiotic resistance in environmental reservoirs (i.e., soil, water, wildlife) threatens the efficacy of all antibiotics. Therefore, there is an urgent need to determine what effective solutions exist to minimize the dissemination of antibiotic resistance in the environment. The aim of this article is to describe the protocol of a systematic review of the literature considering these solutions. Methods The primary questions addressed by the systematic review protocol are: how antibiotic resistance in the environment is impacted by changes in practice concerning (i) the use of antibiotics, (ii) the management of wastes or (iii) the management of the natural compartment. Bibliographic searches will be made in eleven publication databases as well as in specialist databases. Grey literature will also be searched. Articles will be screened regarding the inclusion and exclusion criteria at title, abstract and full-text levels. Studies where a causal relationship between the intervention and the outcome is made will be retained. After critical appraisal, data from the selected articles will be extracted and saved in a database validated by the expert panel. Study quality will be assessed by critical appraisal. Data will be compiled into a qualitative synthesis. If data availability and quality allow it, a quantitative synthesis will be carried out.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,166
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,172
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,166
Score d'incertitude au seuil0,875

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1660,172
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0060,006
Méta-épidémiologie (sens large)0,0180,015
Bibliométrie0,0190,015
Études des sciences et des technologies0,0050,008
Communication savante0,0090,011
Science ouverte0,0080,007
Intégrité de la recherche0,0120,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0510,011

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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