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Enregistrement W2791603395 · doi:10.1111/ajt.14700

Towards donor lung recovery—gene expression changes during ex vivo lung perfusion of human lungs

2018· article· en· W2791603395 sur OpenAlexafffund
Jonathan Yeung, R. Zamel, William Klement, Tiago Machuca, Thomas K. Waddell, Mingyao Liu, Marcelo Cypel, Shaf Keshavjee

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Transplantation · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTransplantation: Methods and Outcomes
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGenome Canada
Mots-clésMedicineLungEx vivoLung transplantationPerfusionTransplantationIn vivoPathologyInflammationGene expressionImmunologyGeneBiologyCardiologySurgeryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We and others have demonstrated that acellular normothermic ex vivo lung perfusion of high-risk donor lungs can result in posttransplant outcomes equivalent to that of contemporaneous lung transplantation using standard donor lungs. However, the mechanism of this effect remains unclear. Given the restoration of cellular metabolic activity during normothermic perfusion, one possibility is that of lung healing via natural innate recovery mechanisms. We explored this by examining the gene expression changes occurring in human lungs during ex vivo lung perfusion. Human lungs clinically rejected for transplantation were perfused for 12 hours of EVLP with biopsies taken at the start, at 1 hour, at 3 hours, and then every 3 hours thereafter to 12 hours. Temporal changes were identified in 2585 genes using the Short Time-series Expression Miner and used for pathway analysis. Despite increases in endothelial markers of inflammation, circulating leukocyte cell-specific gene expression fell over 12 hours of ex vivo lung perfusion (EVLP), suggesting an interrupted inflammation response secondary to washout of circulating leukocytes. Analysis of these gene changes suggests lung recovery follows specific stages: cellular death, cellular preservation, cellular reorganization, and cellular invasion. EVLP may improve posttransplant lung function by washout of leukocytes and facilitating innate mechanisms of repair.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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