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Enregistrement W2791682082 · doi:10.1093/jcag/gwy008.292

A291 INVESTIGATING THE ROLE OF ANTIBIOTICS AND ADHERENT-INVASIVE E. COLIIN THE PATHOGENESIS OF CROHN’S DISEASE

2018· article· en· W2791682082 sur OpenAlexaff
Alexander Oberc, Aline Fiebig‐Comyn, Brian K. Coombes

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntibioticsColonisationBiologyImmune systemMicrobiologyDiseasePathogenesisCrohn's diseaseEtiologyGut floraImmunologyColonizationMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Crohn’s disease (CD) is an immune-mediated intestinal illness that is a significant health concern in many developed countries. CD is believed to have a complex etiology consisting of both host susceptibility factors and environmental insults. Multiple epidemiological studies have linked antibiotics with subsequent CD diagnosis. CD is also associated with increased abundance of an unusual phenotypic group of Escherichia coli known as adherent-invasive E. coli (AIEC) in many patients. AIEC are characterized by their ability to adhere and invade various cell types, to stimulate the production of inflammatory cytokines, and also tend to be resistant to multiple classes of antibiotics. Our lab has found that chronic colonisation of conventional mice with AIEC leads to intestinal inflammation and fibrosis. Our objective was to use this mouse model to investigate the impact of antibiotics on AIEC colonisation, pathology, and immune responses. Mice were treated with various antibiotics in drinking water or by oral gavage. These mice were infected with various doses of AIEC either before or after antibiotic treatment. We found that certain antibiotics administered prior to infection greatly reduced the infectious dose of bacteria required and led to greater bacterial burden. Mice administered antibiotics after infection similarly showed an expansion of AIEC in the feces and tissues. We are continuing to investigate how antibiotics alter AIEC colonisation by studying the metabolic and immune consequences of antibiotic treatment. These results show that antibiotics may create a favourable environment for AIEC colonisation in CD patients. Future work will continue investing how antibiotics impact the gut environment in the context of CD. CIHROntario Graduate Scholarship

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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