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Enregistrement W2791736553 · doi:10.14740/gr947w

Analysis of <i>Helicobacter pylori</i> Genotypes Amongst Jordanians’ Dental Plaque Samples

2018· article· en· W2791736553 sur OpenAlexvenueno aff
Mohammad Abu Lubad, Hamed Alzoubi, Dua’a Jarajreh, Alaa Al Sawalqa, Holger Brüggemann, Eman Albataineh, Amin A. Aqel, Munir A. Al‐Zeer

Notice bibliographique

RevueGastroenterology Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDeutscher Akademischer Austauschdienst
Mots-clésHelicobacter pyloriDental plaqueMedicineGenotypeMicrobiologyDentistryGeneticsBiologyGastroenterology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Helicobacter pylori ( H. pylori ) infection has been associated with gastritis, gastric ulcer, mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma and gastric cancer. The prevalence of H. pylori virulence genes have been studied in different populations and from different sources of samples but their prevalence has not been studied in dental plaque in Jordanian people; therefore, the aim of this study was to determine the genotypes of H. pylori isolated from dental plaque samples. Methods: Dental plaque samples were collected from 60 Jordanian volunteers. The genotypes of H. pylori virulence genes including the cytotoxin-associated gene A ( cagA ) and the vacuolating toxin ( vacA ) were determined using polymerase chain reaction (PCR). Results: The cagA gene was detected in 14 (23.3%) samples, while vacA was detected in all volunteers enrolled in this study (100%). The most prevalent vacA alleles were m2 and s1 in 54 (90%) and 55 (91.7%) of volunteers, respectively. Compared to the other combinations including the most virulent vacA genotype s1/m1 which was detected in 11 (18.2%) of volunteers, the most prevalent vacA allelic combinations were s1/m2 and s2/m2 in 56 (93.3%) and 27 (45%) of volunteers, respectively. Conclusions: These results indicate a significant carriage of virulent H. pylori strains among Jordanian people in their dental plaques, which increases the possible transmission of these strains among them. In addition, the studying of the genotypic pattern of H. pylori virulence genes in the dental plaque could represent an essential tool for infection prevention and predicting the severity and prognosis of H. pylori gastric infection. Gastroenterol Res. 2018;11(1):46-51 doi: https://doi.org/10.14740/gr947w

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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