Blinded comparison of performance and cost-effectiveness of chromogenic and direct latex methods for detection of group B <i>Streptococcus,</i> with in-house PCR and LAMP as reference standards
Notice bibliographique
Résumé
Background: Group B Streptococcus (GBS) testing during pregnancy and application of intrapartum prophylaxis to carriers prevents early-onset disease due to GBS in neonates. New testing methods may be more accurate and cost-effective than conventional cultures. Objective: To compare performance and cost-effectiveness of three chromogenic agars and two direct latex agglutinations after carrot-broth enrichment, using in-house polymerase chain reaction (PCR) and loop-mediated isothermal amplification (LAMP) as reference standards. Methods: A total of 285 consecutive vaginal–rectal swabs were enriched with carrot broth and then tested using conventional Streptococcus selective agar (SSA), ChromAGAR Strep B (Colourex; Alere ULC, Ontario), ChromID Strepto B (bioMérieux Canada, Quebec), Brilliance GBS (Oxoid Company Inc, Ontario) and two latex agglutination kits: PathoDxtra Strep Grouping Reagent Kit (Thermofisher Scientific, Oxoid Company, Ontario) and MEDStrep (Alere ULC, Ontario). In-house PCR and LAMP reference methods were performed on frozen carrot broth. Results: Of the 285 samples received, 244 were analyzed by in-house PCR and 195 by LAMP. The conventional method (SSA) is less sensitive than PCR, but equally specific. Chromogenic agars were as sensitive as or more sensitive than SSA, and cost as much as or more than SSA. Direct latex antigens were less sensitive and specific than SSA, and cost less than SSA. In-house PCR was more sensitive than LAMP. Conclusion: Chromogenic media perform approximately as well as the conventional method (SSA) but are costlier. Direct latex agglutination methods do not achieve adequate performance. The ideal limit of detection for PCR is unknown, since the risk to the newborn of maternal carriage of a low inoculum of GBS is unknown.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».