Tackling rarity and sample bias with large-scale biodiversity monitoring: a case study examining the status, distribution and ecology of the lichen <i>Cladonia rei</i> in Alberta, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Species conservation depends on accurate data, but for many lichens existing collections are geographically biased and contain many taxonomic errors. It is unclear whether ‘non-expert’, systematic monitoring schemes can address these sources of error, particularly for taxonomically challenging lichens (e.g. species requiring chemistry for accurate identification). In this case study we use the Alberta Biodiversity Monitoring Institute (ABMI), a large-scale, systematic, multi-taxon monitoring programme, to better understand the ecology and distribution of a putative rare species, Cladonia rei. Collections of C. rei from Alberta dating from 1947 suggested the species was broadly distributed but rare, with seven accessioned specimens. We used comparative morphology, thin-layer chromatography and habitat modelling to compare historical records against more recent material from ABMI surveys. Contrary to the historical collections, ABMI samples suggest C. rei is almost entirely limited to the dry mixed grassland, northern fescue grassland and aspen parkland natural regions, and that within these ecosystems it is relatively common. The typical ecotype exhibited included a persistent primary thallus, podetia with a persistent basal cortex, and secondary squamules; typically they lacked cups, well-developed apothecia and fumarprotocetraric acid, and ramifications were sparse. Cladonia rei was consistently found in pastures and undisturbed grasslands that hosted relatively rich communities of epigeic lichens, thus it does not appear to act as a pioneer in Alberta or to commonly occupy the anthropogenic niches documented elsewhere. In summary, large-scale, systematic, non-targeted monitoring employing novices redressed issues of sample bias through almost 300 C. rei collections, simultaneously improving the ecological understanding of a putative rare species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».