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Enregistrement W2792016453 · doi:10.1200/jco.2018.36.6_suppl.89

Contribution of microRNA-200b-3p to radiation therapy resistance in 22RV1 prostate cancer cells.

2018· article· en· W2792016453 sur OpenAlexaff
John Thoms, Satoko Aoki, Lourdes Peña‐Castillo

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClonogenic assaymicroRNAProstate cancerCancer researchBiologyCancerCell cultureCell growthProstatePhenotypeMedicineOncologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

89 Background: Radiation therapy (RT) is a standard treatment option for men with localized prostate cancer. Despite having well-established treatment regimens, such men still fail RT at a rate of up to 30-50%. RT resistant phenotype is a key component leading to treatment failure. MicroRNAs (miRNAs) can influence the response to RT, and the abundance or lack of certain miRNAs can induce a RT resistant phenotype through alteration of survival pathways. We show that altered expression of miR-200b-3p plays an important role in contributing to RT resistance. Methods: RT resistant subline from the parental 22RV1 prostate cancer cell line was generated by exposure to fractionated RT – 22RV1-RT. The global expression level of miRNAs and mRNA was determined, using the Affymetrix GeneChip®: miRNA 4.0 and Human Gene 2.0 ST Arrays. Parental and 22RV1-RT cells were transfected with miR-200b-3p mimics or negative control. The influence of miR-200b-3p on cellular proliferation, morphology, migration, clonogenic survival and response to RT was determined by standard assays. Results: MiR-200b-3p was the only miRNA that was statistically differentially expressed between the two cell lines. There were 39 differentially expressed genes. Of the 65 genes predicted to be regulated by miR-200b-3p as identified from miRTarBase, only Fibronectin 1 (FN1) was in common. FN1 was up-regulated in 22RV1- RT cells. MiR-200b-3p mimics; in comparison to negative control mimics, suppressed cell proliferation in both cell lines. Both cell lines with negative control mimics have fibroblastic-type morphology and display a stretched shape following RT. While, cells transfected with miR-200b-3p mimics demonstrated a round morphology and formed clusters following RT. Over-expression of miR-200b-3p mimics inhibited cell migration synergically with RT and demonstrated a lower degree of clonogenic survival following RT in 22RV1-RT cells compared to negative control mimics. Surprisingly, miR-200b-3p mimics reversed the observed RT resistance and the sensitivity to RT was to the same degree as the parental 22RV1 cells. Conclusions: Together, these data suggest that miR-200b-3p independently contributes to RT resistance in 22RV1 prostate cancer cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,437
Écart entre enseignants0,400 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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