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Enregistrement W2792071348 · doi:10.1200/jco.2018.36.6_suppl.260

Determining biomarkers of response to docetaxel for patients with metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC) using circulating cell-free tumor DNA (ctDNA).

2018· article· en· W2792071348 sur OpenAlexaff
Daniel Khalaf, Cameron Herberts, Gillian Vandekerkhove, Matti Annala, Kevin Beja, Bernhard J. Eigl, Christian Kollmannsberger, Lucia Nappi, Joanna Vergidis, Alexander W. Wyatt, Kim N.

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineDocetaxelEnzalutamideProstate cancerOncologyInternal medicinePTENCancerMetastasisAndrogen deprivation therapyAndrogen receptorPI3K/AKT/mTOR pathwayBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

260 Background: Docetaxel is associated with improved outcomes for mCRPC. There are currently no predictive molecular biomarkers for docetaxel to assist with patient selection. Methods: Patients commencing docetaxel for mCRPC between November 2015 and August 2017 were enrolled on a prospective cohort study evaluating circulating biomarkers. A plasma sample for ctDNA analysis was collected before initiation of docetaxel. Targeted sequencing of 73 prostate cancer-relevant genes was performed on leukocyte DNA (germline) and plasma cell-free DNA. Patient records were reviewed for baseline clinical characteristics, PSA response (≥ 50% decline from baseline), and time to PSA progression (TTPP) (PCWG3 criteria). Results: There were 33 patients enrolled; all patients had received prior abiraterone or enzalutamide and none had received prior taxanes. At baseline, the median age was 69.9 years, 30.3% had ECOG performance status 2, 66.7% had bone metastasis and 9.1% had liver metastases. The PSA response rate (RR) was 39.4% and 33.3% had a TTPP less than 3 months. 82% of patients had a ctDNA fraction >5%. Deleterious BRCA2 or ATM defects were present in 12.1% (4/33) of patients (3 somatic and 1 germline). TP53 alterations were identified in 39.4% (13/33), RB1 loss in 21.2% (7/33), PTEN loss in 21.2% (7/33), and Androgen Receptor (AR) amplification in 42.2% (14/33). PTEN deletion was associated with a trend toward inferior RR and TP53 had no discernible effect on PSA RR (Table). BRCA2/ATM defects were associated with a trend toward a lower rate of PSA progression within 3 months (Table). Conclusions: In this preliminary analysis, TP53 alterations had no discernible effect on efficacy of docetaxel chemotherapy. Accrual is ongoing in order to further clarify whether there is an association between PTEN, RB1, AR and BRCA2/ATM alterations and benefit from docetaxel. [Table: see text]

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,345 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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