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Enregistrement W2792077559 · doi:10.1111/cmi.12842

Bovine adenovirus‐3 protein VIII associates with eukaryotic initiation factor‐6 during infection

2018· article· en· W2792077559 sur OpenAlexafffund
Amit Gaba, Lisanework E. Ayalew, Amrutlal K. Patel, Pankaj Kumar, Suresh K. Tikoo

Notice bibliographique

RevueCellular Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyMolecular biologyImmunoprecipitationEukaryotic Small Ribosomal SubunitInitiation factorHSPA4Translation (biology)GenePeptide sequenceMessenger RNAHSPA2Biochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adenovirus protein VIII appears to connect core with the inner surface of the adenovirus capsid. Because protein-protein interactions are central to virus replication, identification of proteins interacting with protein VIII may help in understanding their role in adenovirus infection. Our yeast 2-hybrid assay indicated that protein VIII interacts with eukaryotic initiation factor 6 (eIF6). These findings were confirmed by Glutathione S-transferase-pull down assay, bimolecular fluorescent complementation assay, and coimmunoprecipitation assay in plasmid DNA transfected and bovine adenovirus-3 (BAdV-3) infected cells. The C-terminus amino acids 147 to 174 of protein VIII and N-terminus amino acids 44 to 97 of eIF6 are involved in these interactions. Polysome analysis demonstrated increased level of 60S ribosomal subunit and decreased level of 80S complex in protein VIII expressing cells or BAdV-3 infected cells. Our results suggest that formation of functional 80S ribosome appears impaired in the presence of protein VIII at late times post infection. We speculate that this impaired ribosome assembly may be responsible for the inhibition of cellular mRNA translation observed late in adenovirus infected cells. Moreover, analysis of recombinant BAdV-3 expressing mutant protein VIII (deletion of eIF6 interacting domain) suggests that interaction of protein VIII and eIF6 may help in preferential translation of adenovirus genes during late phase of adenovirus infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,831

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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