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Enregistrement W2792159540 · doi:10.1093/jcag/gwy009.113

A113 LINKING GENE-ENVIRONMENT INTERACTIONS IN IBD: VITAMIN D-MEDIATED REGULATION OF AUTOPHAGY

2018· article· en· W2792159540 sur OpenAlexaff
L. McGillis, S T Johnson, Dana M. Bronte-Tinkew, Frances Dang, David Philpott, Nicola L. Jones

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVitamin D Research Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophagyCalcitriol receptorATG16L1Vitamin D and neurologyvitamin D deficiencyVitaminDownregulation and upregulationBiologyPathogenesisCell biologyEndocrinologyImmunologyGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The incidence of IBD has risen dramatically over the past decade, indicating a role for environmental factors in disease onset. Growing evidence from animal and human studies indicate that vitamin D deficiency is an important environmental factor contributing to IBD pathogenesis, although the exact mechanism involved remains unknown. Autophagy is a pathway that has gained interest for its recently established role in IBD pathogenesis. Previously in our lab, we have shown that inducing vitamin D deficiency in wildtype C57Bl/6 mice causes a significant downregulation of autophagy proteins ATG16L1 and LC3II in the intestine. We aim to elucidate the relationship between vitamin D deficiency and IBD by exploring the effect of vitamin D on intestinal autophagy. We hypothesize that vitamin D deficiency plays a role in the dysregulation of autophagy in the intestine. To complement our previous findings and to directly assess the effect of vitamin D on intestinal epithelial cells and autophagy, we employed in vitro experiments using murine intestinal epithelial (MODE-K) cells and murine intestinal organoids. Cells were incubated with increasing concentrations of the active form of vitamin D. Western blotting was performed to evaluate autophagy markers ATG16L1 and LC3II, as well as the vitamin D receptor (VDR), a vitamin D responsive gene. As expected, a significant and dose-dependent increase in VDR expression was detected in cells incubated with vitamin D. Furthermore, a trend towards increased ATG16L1 was detected in vitamin D treated cells. Our findings suggest that vitamin D upregulates the autophagy protein ATG16L1 providing a potential mechanism by which vitamin D deficiency modulates IBD pathogenesis. Given this interesting interaction between vitamin D and autophagy, the next step of this project is to assess the effect of vitamin D deficiency in the context of IBD susceptibility Nod2 mutations. CCCOGS, Restracomp

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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