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Enregistrement W2792228775

Effect of periphytic Escherichia coli and lake water bacterial population on the biofilm establishment of a Shiga toxin producing Escherichia coli O157:H7 strain

2015· dissertation· en· W2792228775 sur OpenAlexaboutno aff
Tallie Anne MacDonald

Notice bibliographique

RevueKnowledge Commons (Lakehead University) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEscherichia coliMicrobiologyBiofilmPopulationStrain (injury)BiologyShiga toxinToxinChemistryBacteriaMedicine
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biofilm studies Escherichia coli (E. coli) have typically focused on 0157:H7 in \ndefined, laboratory medium. While there is value in such studies, they offer little in the \nway of explaining the behaviour and interactions of this group of bacteria with other \nenvironmental bacteria under biofilm conditions. Furthermore, with evidence mounting to \nsupport the persistence of naturalized populations of E. coli in the environment, a study to \ndetermine the effect of the naturalized E. coli and other environmental microbial \npopulations on the biofilm development of E. coli 0157:H7 is called for. \nThe biofilm developments of E. coli H32 strain (a pathogenic E. coli 0157:H7 strain), \nE coli 1A strain (isolated from a periphyton sample collected at Boulevard Lake, Thunder \nBay, Ontario, Canada) and a microbial population collected from Boulevard Lake were \nexamined using confocal scanning laser microscopy (CSLM). Biofilm formation was studied in a minimal salt medium supplemented with 0.04% glucose (MSMG). The CSLM \nallowed for the determination of biofilm structures. It was observed that the periphytic E. \nco//strain was able to form a thick (approximately 40 pm) structured biofilm which water \nchannels and mushroom-like pillars were observed. The pathogenic E. co//strain H32, \nwas unable to form a structured biofilm. The biofilm was scarce forming a monolayer of \ncoverage. The lake water microbial population was able to form a structured biofilm with lots of variations in structures from mounds to thin layers of cell coverage. The biofilm \nthickness was very diverse ranging from 5 to 30 Mm. \nIn addition, the effect of the periphytic E. coli 1A strain and the lake water bacterial \npopulation on the biofilm establishment of the E. coli 0157:H7 H32 strain was examined. \nIn order to study the interactions between the two E coli strains, a rifampicin resistant \nmutant of 1A (1A-Rif) and a green fluorescent protein gene (gfp) labelled and kanamycin \nresistant H32 mutant (H32-gfp) were created. These two mutant strains were used to \nreplace the 1A and H32 strains in the mixed culture study. Three treatments were \nperformed in the mixed culture study. The first treatment was to determine the biofilm \nestablishment of the pathogenic H32-gfp strain when exposed to a pre-established \nperiphytic E. coli 1A-Rif biofilm. The inoculum densities of the H32-gfp strain in this treatment were 1x10[superscript 7], 1x10 [superscript 6], 1x10[superscript 5] and 1x10 [superscript 4] CFU/mL and the biofilm cell densities of \nH32-gfp and 1 A-Rif were determined by drop-plating after 48 h. At the inoculum density \nof 1x10[superscript 7] CFU/mL of H32-gfp, the pre-established lA-RIf biofilm helped H32-gfp to form more blofilm by increasing the biofllm density of H32-gfp by a magnitude of 1 log, when compared with the monoculture H32-gfp biofilm cell density in the absence of the preestablished 1 A-Rif biofilm. However, at inoculum densities of 1x10[superscript 5] and 1x10 [superscript 4] CFU/mL, the 1 A-Rif biofilm decreased the ability of H32-gfp to form biofllm significantly (p<0.05). The inverse of this experiment was performed where the 1 A-Rif strain was exposed to a pre-established H32-gfp biofilm. In this setting, the pre-established H32-gfp biofilm significantly decreased the ability of 1 A-Rif to form biofilm (p<0.05) regardless the inoculum densities of 1 A-Rif ranging from 1x10 [superscript 7] and 1x10 [superscript 4] CFU/mL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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