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Enregistrement W2792267984 · doi:10.1016/j.nicl.2018.03.026

Automated versus manual segmentation of brain region volumes in former football players

2018· article· en· W2792267984 sur OpenAlexfundno aff
Jeffrey P. Guenette, Robert A. Stern, Yorghos Tripodis, Alicia S. Chua, Vivian Schultz, Valerie J. Sydnor, Nathaniel Somes, Sarina Karmacharya, Christian Lepage, Paweł Wróbel, Michael L. Alosco, Brett Martin, Christine E. Chaisson, Michael J. Coleman, Alexander Lin, Ofer Pasternak, Nikos Makris, Martha E. Shenton, Inga K. Koerte

Notice bibliographique

RevueNeuroImage Clinical · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTraumatic Brain Injury Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesDeutscher Akademischer AustauschdienstAustralian Football LeagueNational Football League Players AssociationLudwig-Maximilians-Universität MünchenJetBlue
Mots-clésSegmentationIntraclass correlationCorpus callosumNeuroimagingBrain sizePsychologyMedicineMagnetic resonance imagingArtificial intelligenceNeuroscienceComputer scienceRadiologyDevelopmental psychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives: To determine whether or not automated FreeSurfer segmentation of brain regions considered important in repetitive head trauma can be analyzed accurately without manual correction. Materials and methods: 3 T MR neuroimaging was performed with automated FreeSurfer segmentation and manual correction of 11 brain regions in former National Football League (NFL) players with neurobehavioral symptoms and in control subjects. Automated segmentation and manually-corrected volumes were compared using an intraclass correlation coefficient (ICC). Linear mixed effects regression models were also used to estimate between-group mean volume comparisons and to correlate former NFL player brain volumes with neurobehavioral factors. Results: Eighty-six former NFL players (55.2 ± 8.0 years) and 22 control subjects (57.0 ± 6.6 years) were evaluated. ICC was highly correlated between automated and manually-corrected corpus callosum volumes (0.911), lateral ventricular volumes (right 0.980, left 0.967), and amygdala-hippocampal complex volumes (right 0.713, left 0.731), but less correlated when amygdalae (right -0.170, left -0.090) and hippocampi (right 0.539, left 0.637) volumes were separately delineated and also less correlated for cingulate gyri volumes (right 0.639, left 0.351). Statistically significant differences between former NFL player and controls were identified in 8 of 11 regions with manual correction but in only 4 of 11 regions without such correction. Within NFL players, manually corrected brain volumes were significantly associated with 3 neurobehavioral factors, but a different set of 3 brain regions and neurobehavioral factor correlations was observed for brain region volumes segmented without manual correction. Conclusions: Automated FreeSurfer segmentation of the corpus callosum, lateral ventricles, and amygdala-hippocampus complex may be appropriate for analysis without manual correction. However, FreeSurfer segmentation of the amygdala, hippocampus, and cingulate gyrus need further manual correction prior to performing group comparisons and correlations with neurobehavioral measures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,459
Score d'incertitude au seuil0,515

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,205
Tête enseignante GPT0,486
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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