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Enregistrement W2792297110 · doi:10.1242/jcs.208199

The Arf-GDP-regulated recruitment of GBF1 to Golgi membranes requires domains HDS1 and HDS2 and a Golgi-localized protein receptor

2018· article· en· W2792297110 sur OpenAlexafffund
Douglas Quilty, Calvin J. Chan, Katherine Yurkiw, A. D. Bain, Ghazal Babolmorad, Paul Melançon

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of AlbertaUniversity of ManchesterUniversity of Georgia
Mots-clésGolgi apparatusBrefeldin ABiologyCell biologyGolgi membraneIn vitroGTPaseEndoplasmic reticulumBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT We previously proposed a novel mechanism by which the enzyme Golgi-specific Brefeldin A resistance factor 1 (GBF1) is recruited to the membranes of the cis-Golgi, based on in vivo experiments. Here, we extended our in vivo analysis on the production of regulatory Arf-GDP and observed that ArfGAP2 and ArfGAP3 do not play a role in GBF1 recruitment. We confirm that Arf-GDP localization is critical, as a TGN-localized Arf-GDP mutant protein fails to promote GBF1 recruitment. We also reported the establishment of an in vitro GBF1 recruitment assay that supports the regulation of GBF1 recruitment by Arf-GDP. This in vitro assay yielded further evidence for the requirement of a Golgi-localized protein because heat denaturation or protease treatment of Golgi membranes abrogated GBF1 recruitment. Finally, combined in vivo and in vitro measurements indicated that the recruitment to Golgi membranes via a putative receptor requires only the HDS1 and HDS2 domains in the C-terminal half of GBF1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,053
Score d'incertitude au seuil0,271

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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