Mixed Fluorotryptophan Substitutions at the Same Residue Expand the Versatility of <sup>19</sup>F Protein NMR Spectroscopy
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The strategy of applying fluorine NMR to characterize ligand binding to a membrane protein prepared with mixtures of tryptophans substituted with F at different positions on the indole ring was tested. The 19 F NMR behavior of 4‐, 5‐, 6‐, and 7‐fluorotryptophan were directly compared as a function of both micellar environment and fragment size for two overlapping apelin receptor (AR/APJ) segments; one with a single transmembrane (TM) helix and two tryptophan residues, the other with three TM helices and two additional tryptophan residues. Chemical shifts, peak patterns, and nuclear spin relaxation rates were observed to vary as a function of micellar conditions and F substitution position in the indole ring, with the exposure of a given residue to micelle or solvent being the primary differentiating factor. Titration of the 3‐TM AR segment biosynthetically prepared as a mixture of 5‐ and 7‐fluorotryptophan‐containing isoforms by two distinct peptide ligands (apelin‐36 and apela‐32) demonstrated site‐specific 19 F peak intensity changes for one ligand but not the other. In contrast, both ligands perturbed 1 H– 15 N HSQC peak patterns to a similar degree. Characterization of multiple fluorotryptophan types for a given set of tryptophan residues, thus, significantly augments the potential to apply 19 F NMR to track otherwise obscure modulation of protein conformation and dynamics without an explicit requirement for mutagenesis or chemical modification.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».