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Enregistrement W2792461892 · doi:10.4236/abb.2018.91002

cDNA Cloning of Paramyosin from Several Kinds of Squid Mantle Muscle

2018· article· en· W2792461892 sur OpenAlexaff
Takayuki Kajita, Yoshiko Takeda, Saki Yoshida, Koki Yamada, Masahiro Matsumiya, Hideto Fukushima

Notice bibliographique

RevueAdvances in Bioscience and Biotechnology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMarine Biology and Environmental Chemistry
Établissements canadiensNutrasource
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHaliotis discusCuttlefishOpen reading frameBiologySquidComplementary DNAAbaloneCrassostreaoctopus (software)GeneOysterAnatomyFisheryGeneticsPeptide sequenceChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Paramyosin is a rod-shaped muscle protein found exclusively in invertebrates, with α-helices coiled around each other to form a coiled-coil structure. Marine organisms in which the primary structure of paramyosin has been determined are mollusks, including abalone (Haliotis discus), mussels (Mytilus galloprovincialis), octopus (Octopus bimaculoides), and oyster (Crassostrea gigas). In contrast, the primary structure of squid paramyosin, which is of particular interest, has yet to be reported. In the present study, cDNA cloning of paramyosins from four squid species, the neon flying squid (Ommastrephes bartramii), the Humboldt squid (Dosidicus gigas), the golden cuttlefish (Sepia esculenta), and the clawed armhook squid (Gonatus onyx), was performed to determine the following: the 2605-bp O. bartramii paramyosin gene containing a 2574-bp open reading frame (ORF), the 2691-bp D. gigas paramyosin gene containing a 2640-bp ORF, the 2631-bp S. esculenta paramyosin gene containing a 2574 ORF, and the 2609-bp G. onyx paramyosin gene containing a 2574-bp ORF. The primary structure of the four squid paramyosins was found to contain heptad repeats and an ACD (assembly competence domain), which are characteristic of a coiled coil. A phylogenetic analysis was performed with paramyosin sequences from species including the four squid species examined in this study, the results of which indicated that the four squid paramyosins form a group independent from the paramyosins of other species, to which octopus paramyosins are closest.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,360

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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