Preliminary studies on isolates of Clostridium difficile from dogs and exotic pets
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Clostridium difficile infection (CDI) is recognised as an emerging disease in both humans and some animal species. During the past few years, insights into human CDI epidemiology changed and C. difficile is also considered as an emerging community-acquired pathogen. Certain ribotypes (RT) are possibly associated with zoonotic transmission. The objective of this study was to assess the presence of C. difficile in a population of pets and to characterise the isolates. RESULTS: Faecal samples from a total of 90 diarrhoeic dogs and 24 from exotic animal species (both diarrhoeic and non-diarrhoeic) were analysed. Clostridium difficile was isolated from 6 (6.7%) dogs and one reptile sample (4.2%). Four (66.7%) of the six dog strains were capable of producing toxins. Four known different RTs were detected in dogs (010, 014, 123 and 358) and a new one was found in a faecal sample of an exotic animal. This new RT isolate was negative for all toxin genes tested and belonged to sequence type 347 which has been proposed as a Clade-III member. Importantly, two dog strains showed a stable resistance to metronidazole (initial MIC values: 128 and 48 μg/ml). CONCLUSIONS: The results obtained in this study suggest the implementation of antimicrobial susceptibility surveillance programs to assess the prevalence of metronidazole resistance in dogs; molecular studies to elucidate C. difficile metronidazole resistance mechanisms are warranted. Based on the similarity between the ribotypes observed in dogs and those described in humans, the zoonotic transmission should be further explored. Furthermore, exotic animals have shown to harbor uncommon C. difficile strains which require further genomic studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».