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Enregistrement W2792568216 · doi:10.1016/j.tmaid.2018.02.007

The role of ‘filth flies’ in the spread of antimicrobial resistance

2018· review· en· W2792568216 sur OpenAlexaff
Francis C. Onwugamba, J. Ross Fitzgerald, Kateryn Rochon, Luca Guardabassi, Abraham Alabi, Stefan Kühne, Martin P. Grobusch, Frieder Schaumburg

Notice bibliographique

RevueTravel Medicine and Infectious Disease · 2018
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueForensic Entomology and Diptera Studies
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilUniversitair Medisch Centrum GroningenBundesministerium für Bildung und ForschungWestfälische Wilhelms-Universität MünsterJoint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance
Mots-clésAntimicrobialAntibiotic resistanceResistance (ecology)BiologyAnti-Infective AgentsMicrobiologyZoologyEcologyAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: 'Filth flies' feed and develop in excrement and decaying matter and can transmit enteric pathogens to humans and animals, leading to colonization and infection. Considering these characteristics, 'filth flies' are potential vectors for the spread of antimicrobial resistance (AMR). This review defines the role of flies in the spread of AMR and identifies knowledge gaps. METHODS: The literature search (original articles, reviews indexed for PubMed) was restricted to the English language. References of identified studies were screened for additional sources. RESULTS: 'Filth flies' are colonized with antimicrobial-resistant bacteria of clinical relevance. This includes extended spectrum beta-lactamase-, carbapenemase-producing and colistin-resistant (mcr-1 positive) bacteria. Resistant bacteria in flies often share the same genotypes with bacteria from humans and animals when their habitat overlap. The risk of transmission is most likely highest for enteric bacteria as they are shed in high concentration in excrements and are easily picked up by flies. 'Filth flies' can 'bio-enhance' the transmission of AMR as bacteria multiply in the digestive tract, mouthparts and regurgitation spots. CONCLUSION: To better understand the medical importance of AMR in flies, quantitative risk assessment models should be refined and fed with additional data (e.g. vectorial capacity, colonization dose). This requires targeted ecological, epidemiological and in vivo experimental studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations140
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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