The prevalence of CMY-2, OXA-48 and KPC-2 genes in clinical isolates of Klebsiella spp.
Notice bibliographique
Résumé
Klebsiella pneumoniae is a Gram-negative bacterium which causes several human infections. Treatment of infections related to K. pneumoniae has become problematic, because of increasing trend of extended spectrum β-lactamases producing (ESBLs) strains. The present study was aimed to detect the prevalence of ESBL-producing Klebsiella spp. and KPC-2, CMY-2 and OXA-48 β-lactamase encoding genes in clinical isolates of Klebsiella spp. isolated from hospitalized patients. In this cross-sectional study carried out from February to August 2014, 144 isolates of Klebsiella spp. were collected from different clinical specimens in hospitals in the North of Iran. Klebsiella isolates were identified using standard microbiological procedure. Antimicrobial susceptibility patterns were determined using disk diffusion method in accordance with CLSI recommendation. The presence of antibiotic resistance genes were investigated by PCR method. Among 144 Klebsiella spp., 118 isolates were identified as K. pneumoniae and 26 isolates as Klebsiella oxytoca. Antibiotic susceptibility test showed the most resistance rates were against amoxicillin (96.5%) and ampicillin (95.8%). On the other hand, the most effective antibiotic was revealed to be imipenem with resistance rate of 4.9% (Table 2). Among 144 isolated Klebsiella strains, 57 cases (39.6%) were ESBL producers. The OXA-48 and KPC-2 genes were not detected among Klebsiella spp. during the present study, but 21.1% of isolates contained CMY-2 gene. This is the first report of CMY-2 gene detection in Klebsiella spp. in Iran. The homology between CMY-2 genes identified in isolates from Northern Iran and in other countries showed the wide dispersion of this gene around the world.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».