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Enregistrement W2792658750 · doi:10.1186/s12862-018-1118-0

Wnt signaling and polarity in freshwater sponges

2018· article· en· W2792658750 sur OpenAlexafffund
Pamela J. Windsor Reid, Eugueni Matveev, Alexandra McClymont, Dora Posfai, April Hill, Sally P. Leys

Notice bibliographique

RevueBMC Evolutionary Biology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMarine Sponges and Natural Products
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHoward Hughes Medical InstituteStony Brook UniversityNational Science Foundation
Mots-clésWnt signaling pathwaySpongeBiologyGene knockdownCell biologyPolarity (international relations)Developmental biologyTranscriptomeLRP6Signal transductionEvolutionary biologyAnatomyGeneGeneticsGene expressionBotanyCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The Wnt signaling pathway is uniquely metazoan and used in many processes during development, including the formation of polarity and body axes. In sponges, one of the earliest diverging animal groups, Wnt pathway genes have diverse expression patterns in different groups including along the anterior-posterior axis of two sponge larvae, and in the osculum and ostia of others. We studied the function of Wnt signaling and body polarity formation through expression, knockdown, and larval manipulation in several freshwater sponge species. RESULTS: Sponge Wnts fall into sponge-specific and sponge-class specific subfamilies of Wnt proteins. Notably Wnt genes were not found in transcriptomes of the glass sponge Aphrocallistes vastus. Wnt and its signaling genes were expressed in archaeocytes of the mesohyl throughout developing freshwater sponges. Osculum formation was enhanced by GSK3 knockdown, and Wnt antagonists inhibited both osculum development and regeneration. Using dye tracking we found that the posterior poles of freshwater sponge larvae give rise to tissue that will form the osculum following metamorphosis. CONCLUSIONS: Together the data indicate that while components of canonical Wnt signaling may be used in development and maintenance of osculum tissue, it is likely that Wnt signaling itself occurs between individual cells rather than whole tissues or structures in freshwater sponges.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,528
Score d'incertitude au seuil0,380

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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