High‐sensitivity 5‐, 6‐, and 7‐color PNH WBC assays for both Canto II and Navios platforms
Notice bibliographique
Résumé
Background Paroxysmal Nocturnal Hemoglobinuria (PNH) is a rare acquired hematopoietic stem cell disorder characterized by an inability to make Glyco‐Phosphatidyl‐Inositol (GPI)‐linked cell surface structures. Fluorescent proaerolysin (FLAER‐Alexa488) is increasingly used to detect GPI‐deficient WBCs by flow cytometry. However, FLAER is not available in all countries and is expensive to obtain in others. An earlier study to compare FLAER‐based and non‐FLAER assays confirmed very good agreement between the two tubes suggesting a cost effective simultaneous evaluation of PNH neutrophils and monocytes is possible without FLAER. Methods We have used a single tube approach with a 7‐color assay comprising FLAER‐CD157‐CD15‐CD64‐CD24‐CD14‐CD45. Conjugates were carefully selected and validated so that stained samples could be analyzed on either 10‐color Navios or 8‐color FACSCanto II platforms. The 6‐color (minus CD14) and 5‐color (minus CD24 and CD14) versions were also developed and compared with our predicate clinical lab 5‐color assay comprising FLAER‐CD157PE‐CD64ECD‐CD15PC5‐CD45PC7. Results/Conclusions CD15‐gated PNH neutrophil clone size was quantified using either FLAER and CD157, FLAER and CD24, or CD157 and CD24. CD64‐gated PNH monocyte clone size was quantified using either FLAER and CD157, FLAER and CD14, or CD157 and CD14. Analysis of >40 PNH samples showed that the FLAER‐based plots derive virtually identical data to the non‐FLAER plot for neutrophils (R2 = 1) and monocytes (R2 = 0.9999) and that closely similar data can be acquired using both Canto II and Navios platforms with 7‐, 6‐, and 5‐color versions of the assay. Assessment of non‐PNH samples confirmed extremely low background rate of PNH phenotypes (neutrophils and monocytes) with all three approaches. © 2018 International Clinical Cytometry Society
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,009 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».