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Enregistrement W2792808338 · doi:10.1101/mcs.a002535

Molecular characterization of <i>ERBB2</i>-amplified colorectal cancer identifies potential mechanisms of resistance to targeted therapies: a report of two instructive cases

2018· article· en· W2792808338 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular Case Studies · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Treatments and Studies
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreBC Cancer AgencyVancouver General HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCommon FundNIH Office of the DirectorNational Human Genome Research InstituteNational Cancer InstituteBC Cancer FoundationNational Institutes of HealthGenome CanadaCanadian Institutes of Health ResearchGenome British Columbia
Mots-clésKRASPTENFluorescence in situ hybridizationColorectal cancerTargeted therapyCancer researchBiologyCopy-number variationMicrosatellite instabilityLoss of heterozygosityGeneCancerMolecular biologyGeneticsGenomeMicrosatellitePI3K/AKT/mTOR pathwaySignal transductionAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ERBB2 amplification has been identified in ∼5% of KRAS wild-type colorectal cancers (CRCs). A recent clinical trial showed response to HER2-directed therapy in a subset of ERBB2 -amplified metastatic CRCs resistant to chemotherapy and EGFR-directed therapy. With the aim of better understanding mechanisms of resistance to HER2-directed and EGFR-directed therapies, we report the complete molecular characterization of two cases of ERBB2 -amplified CRC. PCR-free whole-genome sequencing was used to identify mutations, copy-number alterations, structural variations, and losses of heterozygosity. ERBB2 copy number was also measured by fluorescence in situ hybridization. Single-stranded mRNA sequencing was used for gene expression profiling. Immunohistochemistry and protein mass spectrometry were used to quantify HER2 protein expression. The cases showed ERBB2 copy number of 86 and 92, respectively. Both cases were immunohistochemically positive for HER2 according to CRC-specific scoring criteria. Fluorescence in situ hybridization and protein mass spectrometry corroborated significantly elevated ERBB2 copy number and abundance of HER2 protein. Both cases were microsatellite stable and without mutation of RAS pathway genes. Additional findings included altered expression of PTEN , MET , and MUC1 and mutation of PIK3CA . The potential effects of the molecular alterations on sensitivity to EGFR and HER2-directed therapies were discussed. Identification of ERBB2 amplification in CRC is necessary to select patients who may respond to HER2-directed therapy. An improved understanding of the molecular characteristics of ERBB2 -amplified CRCs and their potential mechanisms of resistance will be useful for future research into targeted therapies and may eventually inform therapeutic decision-making.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,926

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle