Copy number variation in fetal alcohol spectrum disorder
Notice bibliographique
Résumé
Fetal alcohol spectrum disorder (FASD) is characterized by a combination of neurological, developmental, and congenital defects that may occur as a consequence of prenatal alcohol exposure. Earlier reports showed that large chromosomal anomalies may link to FASD. Here, we examined the prevalence and types of copy number variations (CNVs) in FASD cases previously diagnosed by a multidisciplinary FASD team in sites across Canada. We genotyped 95 children with FASD and 87 age-matched, typically developing controls on the Illumina Human Omni2.5 SNP (single nucleotide polymorphisms) array platform. We compared their CNVs with those of 10 851 population controls to identify rare CNVs (<0.1% frequency), which may include large unbalanced chromosomal abnormalities, that might be relevant to FASD. In 12/95 (13%) of the FASD cases, rare CNVs were found that impact potentially clinically relevant developmental genes, including the CACNA1H involved in epilepsy and autism, the 3q29 deletion disorder, and others. Our results show that a subset of children diagnosed with FASD have chromosomal deletions and duplications that may co-occur or explain the neurodevelopmental impairments in a diagnosed cohort of FASD individuals. Children suspected to have FASD with or without sentinel facial features of fetal alcohol syndrome and neurodevelopmental delays should potentially be evaluated by a clinical geneticist and possibly have genetic investigations as appropriate to exclude other etiologies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».