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Enregistrement W2792931810 · doi:10.1038/s41598-018-22150-x

An allosteric link connecting the lipid-protein interface to the gating of the nicotinic acetylcholine receptor

2018· article· en· W2792931810 sur OpenAlexafffund
Jaimee A. Domville, John E. Baenziger

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNicotinic Acetylcholine Receptors Study
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGatingAllosteric regulationTransmembrane domainNicotinic acetylcholine receptorTransmembrane proteinBiophysicsLipid bilayerChemistryAcetylcholine receptorProtein structureIon channelMutationCell biologyReceptorBiochemistryBiologyMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mechanisms underlying lipid-sensing by membrane proteins is of considerable biological importance. A unifying mechanistic question is how a change in structure at the lipid-protein interface is translated through the transmembrane domain to influence structures critical to protein function. Gating of the nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) is sensitive to its lipid environment. To understand how changes at the lipid-protein interface influence gating, we examined how a mutation at position 418 on the lipid-facing surface of the outer most M4 transmembrane α-helix alters the energetic couplings between M4 and the remainder of the transmembrane domain. Human muscle nAChR is sensitive to mutations at position 418, with the Cys-to-Trp mutation resulting in a 16-fold potentiation in function that leads to a congenital myasthenic syndrome. Energetic coupling between M4 and the Cys-loop, a key structure implicated in gating, do not change with C418W. Instead, Trp418 and an adjacent residue couple energetically with residues on the M1 transmembrane α-helix, leading to a reorientation of M1 that stabilizes the open state. We thus identify an allosteric link connecting the lipid-protein interface of the nAChR to altered channel function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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