P870 Faecal microbiota in treatment-naive ulcerative colitis and its relation to treatment escalation
Notice bibliographique
Résumé
Ulcerative colitis (UC) is a chronic inflammatory disease affecting the large intestine. The disease course varies from an indolent disease to an aggressive disease, requiring early introduction of biologics and colectomy in treatment refractory individuals. There is a clinical need of biomarkers that can be used to predict the future disease course already at diagnosis. Microbiota signatures might be of help in this respect and could potentially become a tool for the implementation of personalised medicine. Fecal samples were collected at diagnosis from 47 treatment-naïve UC patients in the IBD-character cohort. Extent of inflammation was defined according to the Montreal classification. Fecal microbiota composition was assessed using the GA-map™ Dysbiosis Test [Casén et al., 2015] Patients were followed prospectively for up to 5 years and information on treatment escalation and surgery was collected. Patients were categorised into two groups based on need of treatment escalation, defined as introduction of biologics and/or colectomy during the study period. Differences between groups were compared by using the Wilcoxon test. Among 47 UC patients, 38 (81%) were classified as dysbiotic (12 mild and 26 severe). A total of 6 (13%) patients required treatment escalation. Patients with extensive colitis (E3) seemed to be more likely to require treatment escalation than patients with left-sided colitis (E2) or proctitis (E1) [OR = 4.8, 95% CI (0.78–30.0); p = 0.09)]. No significant association was found between the severity of dysbiosis and treatment escalation during follow-up (p > 0.05). The total abundance of bacteria (p = 0.008) as well as the abundance of Ruminococcus gnavus (p = 0.03), Lactobacillus spp. (p = 0.03), Mycoplasma hominis (p = 0.04), and Streptococcus spp. (p = 0.04) was significantly lower in patients who required treatment escalation compared with patients who did not require escalation (p = 0.008). Decreased abundance of Ruminococcus gnavus, Lactobacillus spp., Mycoplasma hominis, and Streptococcus spp. at diagnosis of UC seems to be associated with a more aggressive disease, requiring the introduction of biological therapies or colectomy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».