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Enregistrement W2793255951 · doi:10.1124/jpet.117.247163

Identification and Characterization of Novel Receptor-Interacting Serine/Threonine‐Protein Kinase 2 Inhibitors Using Structural Similarity Analysis

2018· article· en· W2793255951 sur OpenAlexafffund
Mohamed Salla, Gaddafi I. Danmaliki, Alaa Zare, Ahmed M. Said, Jack Moore, Vrajesh Pandya, Robin Manaloor, Sunny Fong, Anna R. Blankstein, Spencer B. Gibson, Laura Ramos Garcia, Pascal Meier, Khushwant S. Bhullar, Basil P. Hubbard, Yahya Fiteh, Harissios Vliagoftis, Ing Swie Goping, Dion R. Brocks, Peter H. Hwang, Carlos A. Velázquez-Martínez, Shairaz Baksh

Notice bibliographique

RevueJournal of Pharmacology and Experimental Therapeutics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytokine Signaling Pathways and Interactions
Établissements canadiensUniversity of ManitobaWomen and Children’s Health Research InstituteUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesFondation pour la Recherche MédicaleAlberta InnovatesWomen and Children's Health Research Institute
Mots-clésPonatinibInflammationChemistryKinaseCancer researchDocking (animal)PharmacologySignal transductionBiologyCell biologyBiochemistryMedicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Receptor-interacting protein kinase 2 (RIP2 or RICK, herein referred to as RIPK2) is linked to the pathogen pathway that activates nuclear factor <i>κ</i>-light-chain-enhancer of activated B cells (NF<i>κ</i>B) and autophagic activation. Using molecular modeling (docking) and chemoinformatics analyses, we used the RIPK2/ponatinib crystal structure and searched in chemical databases for small molecules exerting binding interactions similar to those exerted by ponatinib. The identified RIPK2 inhibitors potently inhibited the proliferation of cancer cells by &gt; 70% and also inhibited NF<i>κ</i>B activity. More importantly, in vivo inhibition of intestinal and lung inflammation rodent models suggests effectiveness to resolve inflammation with low toxicity to the animals. Thus, our identified RIPK2 inhibitor may offer possible therapeutic control of inflammation in diseases such as inflammatory bowel disease, asthma, cystic fibrosis, primary sclerosing cholangitis, and pancreatitis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,370

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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