MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2793281928 · doi:10.1093/jcag/gwy009.130

A130 CHARACTERIZATION OF GASTROINTESTINAL TRACT PATHOLOGY IN PATIENTS WITH COMMON VARIABLE IMMUNODEFICIENCY DISORDER (CVID)

2018· article· en· W2793281928 sur OpenAlexaff
Amir Rumman, Sarah S. Al Ghamdi, Rabia Khan, Abbas Ali Bukhari, Michael A. Scaffidi, Ahmed Al‐Mazroui, M J Abunassar, Stephen Betschel, Samir C. Grover

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCommon variable immunodeficiencyMedicineInternal medicineGastroenterologyCohortPrimary immunodeficiencyRetrospective cohort studyAbdominal painInflammatory bowel diseaseIncidence (geometry)HypogammaglobulinemiaPediatricsDiseaseImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Common variable immunodeficiency disorder (CVID) is the most common symptomatic primary immunodeficiency disorder. Patients with CVID are reported to have a significant burden of infectious and inflammatory gastrointestinal (GI) diseases. This study aims to characterize the incidence and clinical profile of GI pathology in a cohort of CVID patients. We conducted a retrospective cohort study of all CVID patients followed at an tertiary care hospital between January 2005 and July 2017. Using a standardized data collection tool, we performed chart reviews to identify CVID patients with GI complaints, infections and medication use, as well as patients undergoing endoscopic investigations. Patients with inflammatory bowel disease (IBD) were identified. Baseline demographic and clinical characteristics relating to CVID stage and treatment were also collected. A total of 106 patients were identified and included in the final analyses. Mean age at study inclusion was 52.8 (standard deviation, SD = 14.8), mean age at CVID diagnosis was 38.7 (SD = 16.0 years) and 43/106 (40.6%) were male. Mean IgG level was 9.0 (SD = 3.6 g/L). Most patients (98.1%) were on IVIG replacement therapy, and 56/106 (52.8%) were on chronic steroid therapy. GI symptoms (abdominal pain, change in bowel habits, or weight loss), were reported by 67/106 (63.2%) patients. GI infections were encountered as follows: C. difficile infection in 4 (3.8%), chronic giardiasis in 14 (13.2%), bacterial enterocolitis in 8 (7.5%), CMV colitis in 3 (2.8%) and H. pylori infection in 4 (3.8%). Proton pump inhibitor use was reported by 29.2% of patients and exposure to an antibiotic to treat a GI-related infection was reported by 37.7% of patients. Seven patients (6.6%) had elevated transaminases. Colonoscopy was performed in 52 (49.1%) patients. Of those, 27 (51.9%) had an inflammatory colitis based on either endoscopic or histologic abnormalities. Based on a standardised review of endoscopic and histologic reports, we classified the disease phenotype as follows: 9 (8.5%) with Crohn disease, 2 (1.9%) with ulcerative colitis, 11 (10.4%) with indeterminate colitis, and 5 (4.7%) with microscopic colitis. Patients with CVID have a significant burden of both infectious and inflammatory GI pathology. Clinical and demographic predictors of developing significant GI pathology have not been identified. Further studies are needed to delineate predictors and outcomes of GI pathology in this patient population. None

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,177
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the Canadian Association of GastroenterologyMême sujetImmunodeficiency and Autoimmune DisordersTravaux en français237 207