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Bacterial Seed Endophytes of Domesticated Cucurbits Antagonize Fungal and Oomycete Pathogens Including Powdery Mildew

2018· article· en· 129 citations· W2793302590 sur OpenAlex· 10.3389/fmicb.2018.00042

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.
Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Prédiction distillée sur la base complète

Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

Catégories candidates
aucune
Catégories consensuelles
aucune
Domaine
Signal candidat: aucuneSignal consensuel: aucune
Devis d'étude
Signal candidat: Expérimental (laboratoire)Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
Genre
Signal candidat: EmpiriqueSignal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants
0,348
Score d'incertitude au seuil
0,306
Statut de validation
machine_predicted_unvalidated · codex-gemma-dda1882f352a

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants
0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

The cucurbit vegetables, including cucumbers, melons and pumpkins, have been cultivated for thousands of years without fungicides. However, their seed germination stage is prone to be infected by soil-borne fungal and oomycete pathogens. Endophytes are symbionts that reside inside plant tissues including seeds. Seed endophytes are founders of the juvenile plant microbiome and can promote host defence at seed germination and later stages. We previously isolated 169 bacterial endophytes associated with seeds of diverse cultivated cucurbits. We hypothesized that these endophytes can antagonize major fungal and oomycete pathogens. Here we tested the endophytes for in vitro antagonism (dual culture assays) against important soil-borne pathogens (Rhizoctonia solani, Fusarium graminearum, Phytophthora capsici, Pythium aphanideratum). The endophytes were also assayed in planta (leaf disc and detached leaf bioassays) for antagonism against a foliar pathogen of global importance, Podosphaera fuliginea, the causative agent of cucurbit powdery mildew. The endophytes were further tested in vitro for secretion of volatile organic compounds (VOCs) known to induce plant defence. Extracellular ribonuclease activity was also tested, as a subset of pathogenesis-related (PR) proteins of plant hosts implicated in suppression of fungal pathogens displays ribonuclease activity. An unexpected majority of the endophytes (70%, 118/169) exhibited antagonism to the five phytopathogens, of which 68% (50/73) of in vitro antagonists belong to the genera Bacillus and Paenibacillus. All Lactococcus and Pantoea endophytes exhibited anti-oomycete activity. However, amongst the most effective inoculants against Podosphaera fuliginea were Pediococcus and Pantoea endophytes. Interestingly, 67% (113/169) of endophytes emitted host defence inducing VOCs (acetoin/diacetyl) and 62% (104/169) secreted extracellular ribonucleases in vitro, respectively. These results showed that seeds of cultivated cucurbits package microbes with significant disease-suppression potential. As seeds can act as vectors for genetic transmission of endophytes across host generations, it is interesting to hypothesize whether humans, when selecting seeds of healthy hosts, may have inadvertently selected for a disease-suppressing seed endophytes. As the majority of pathogen-suppressing endophytes belonged to Bacillus and Paenabacillus, and since Bacilli are widely used as commercial biocontrol agents of vegetables, we propose that these agents are mimicking the ecological niche established by their endophytic cousins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Frontiers in Microbiology
Thématique
Plant-Microbe Interactions and Immunity
Domaine
Agricultural and Biological Sciences
Établissements canadiens
University of Guelph
Organismes subventionnaires
Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural Affairs
Mots-clés
BiologyOomycetePowdery mildewBotanyAntagonismAntibiosisMicrofungiRhizoctonia solaniFusarium oxysporumEndophytePathosystemMicrobiologyPathogenBacteria
Résumé présent dans OpenAlex
oui