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Enregistrement W2793626900 · doi:10.1094/phyto-08-17-0289-r

Race Characterization of Phytophthora Root Rot on <i>Capsicum</i> in Taiwan as a Basis for Anticipatory Resistance Breeding

2018· article· en· W2793626900 sur OpenAlexaff
Derek W. Barchenger, Z.M. Sheu, Sanjeet Kumar, Shih-wen Lin, Rishi R. Burlakoti, Paul W. Bosland

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesNew Mexico State UniversityPurdue UniversityUnited States Agency for International Development
Mots-clésPhytophthora capsiciBiologyOomyceteRace (biology)VirulencePhytophthoraPepperPopulationRoot rotCultivarMating typeBiotechnologyCropPlant breedingHost (biology)AgronomyBotanyGeneticsHorticulturePathogenGeneDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Peppers (Capsicum sp.) are an increasingly important crop because of their use as a vegetable, spice, and food colorant. The oomycete Phytophthora capsici is one of the most devastating pathogens to pepper production worldwide, causing more than $100 million in losses annually. Developing cultivars resistant to P. capsici is challenging because of the many physiological races that exist and new races that are continuously evolving. This problem is confounded by the lack of a universal system of race characterization. As a basis to develop a global anticipatory breeding program, New Mexico recombinant inbred lines (NMRILs) functioned as a host differential for Phytophthora root rot to characterize the race structure of P. capsici populations in Taiwan. Using the NMRILs, 24 new races were identified, illustrating the utility and usefulness of the NMRILs for anticipatory breeding. Virulence of P. capsici was observed to be geographically specific and in two virulence clusters. Interestingly, all but two isolates collected in 2016 were the A2 mating type, which is a shift from the predominantly A1 mating type isolates collected prior to 2008. The NMRILs host differential provides an approach for scientists to work together on a global scale when breeding for resistance as well as on a local level for regional gene deployment. Additionally, we propose that the current race numbering system, which has no biological meaning, be supplemented with the virulence phenotype, based on the susceptible NMRILs to a given isolate. This work provides insights into the population dynamics of P. capsici and interactions within the highly complex Capsicum-Phytophthora pathosystem, and offers a basis for similar research in other crops.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,833
Score d'incertitude au seuil0,300

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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