A81 FUNCTIONAL ANALYSIS IMPLICATING SAMD9 MUTATION FOR INTESTINAL INFLAMMATION IN PATIENTS WITH MIRAGE SYNDROME AND INFLAMMATORY BOWEL DISEASE
Notice bibliographique
Résumé
MIRAGE syndrome is caused by heterozygous mutation in the SAMD9 gene. The syndrome is characteristic of enteropathy, and is often fatal within the first 2 years of life. However, the pathogenesis of enteropathy in the syndrome is unknown. We present a case of MIRAGE syndrome (gestational age 35 weeks, birth weight 1330g) who developed restriction of growth, adrenal hypoplasia, genital anomaly, and enteropathy at the time of birth. Sigmoidoscopy showed longitudinal ulcers in rectum. Aim of this study is (1) to identify whether SAMD9 mutation is involved in early onset inflammatory bowel disease (IBD), and (2) to investigate the involvement of SAMD9 mutation in colitis. (1) Whole exome sequence (WES) results performed for IBD patients and their families in The Hospital for Sick Children were reviewed. Mucosal expression of SAMD9 in patients’ biopsy samples were investigated by immunohistochemistry. (2) We assessed difference in TNF-alpha responsiveness between wild type (WT) or mutated (R1293W) SAMD9 using stably expressing HEK293 cell lines. Difference in apoptosis were measured using western blotting and Caspase assays. (1) Among our WES data, 3 patients from 2 families (2 ulcerative colitis, 1 colonic Crohn’s disease) had mutation in SAMD9 gene. Biopsy samples from IBD patients showed increased SAMD9 signals by immunohistochemistry, whereas those from MIRAGE syndrome patient and these 3 patients showed decreased signals. (2) R1293W expressing cells showed increased expression of cleaved Poly ADP-ribose polymerase (PARP) when compared with WT and control. X-Linked inhibitor of apoptosis (XIAP), a known apoptosis inhibitor involves in early onset IBD, were decreased in R1293W mutations. Caspase assay showed increased caspase 3/7 activity in mutated cell lines. Apoptosis was also observed in pathology of the patient’s intestinal mucosal biopsy specimen. SAMD9 might be a novel gene associated with development of pediatric IBD. Suppression of XIAP might result in increased apoptosis and intestinal inflammation observed in patients with SAMD9 mutation. None
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».