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Enregistrement W2793775396 · doi:10.1093/jcag/gwy009.081

A81 FUNCTIONAL ANALYSIS IMPLICATING SAMD9 MUTATION FOR INTESTINAL INFLAMMATION IN PATIENTS WITH MIRAGE SYNDROME AND INFLAMMATORY BOWEL DISEASE

2018· article· en· W2793775396 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicroscopic Colitis
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInflammatory bowel diseaseGastroenterologyUlcerative colitisInternal medicinePathogenesisPathologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MIRAGE syndrome is caused by heterozygous mutation in the SAMD9 gene. The syndrome is characteristic of enteropathy, and is often fatal within the first 2 years of life. However, the pathogenesis of enteropathy in the syndrome is unknown. We present a case of MIRAGE syndrome (gestational age 35 weeks, birth weight 1330g) who developed restriction of growth, adrenal hypoplasia, genital anomaly, and enteropathy at the time of birth. Sigmoidoscopy showed longitudinal ulcers in rectum. Aim of this study is (1) to identify whether SAMD9 mutation is involved in early onset inflammatory bowel disease (IBD), and (2) to investigate the involvement of SAMD9 mutation in colitis. (1) Whole exome sequence (WES) results performed for IBD patients and their families in The Hospital for Sick Children were reviewed. Mucosal expression of SAMD9 in patients’ biopsy samples were investigated by immunohistochemistry. (2) We assessed difference in TNF-alpha responsiveness between wild type (WT) or mutated (R1293W) SAMD9 using stably expressing HEK293 cell lines. Difference in apoptosis were measured using western blotting and Caspase assays. (1) Among our WES data, 3 patients from 2 families (2 ulcerative colitis, 1 colonic Crohn’s disease) had mutation in SAMD9 gene. Biopsy samples from IBD patients showed increased SAMD9 signals by immunohistochemistry, whereas those from MIRAGE syndrome patient and these 3 patients showed decreased signals. (2) R1293W expressing cells showed increased expression of cleaved Poly ADP-ribose polymerase (PARP) when compared with WT and control. X-Linked inhibitor of apoptosis (XIAP), a known apoptosis inhibitor involves in early onset IBD, were decreased in R1293W mutations. Caspase assay showed increased caspase 3/7 activity in mutated cell lines. Apoptosis was also observed in pathology of the patient’s intestinal mucosal biopsy specimen. SAMD9 might be a novel gene associated with development of pediatric IBD. Suppression of XIAP might result in increased apoptosis and intestinal inflammation observed in patients with SAMD9 mutation. None

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,147
Score d'incertitude au seuil0,868

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle