P8 Propionate anions accumulated in propionic acidaemia influences the cardiac gene expression landscape
Notice bibliographique
Résumé
Propionic acidaemia (PA) is an autosomal recessive disorder characterised by malfunctional mitochondrial propionyl-CoA carboxylase. Consequences of this inborn error of metabolism (IEM) is defective catabolism of propiogenic substrates (branched-chain amino acids, odd-number fatty acids, etc.) leading to mitochondrial accumulation of propionyl CoA and its derivatives. Accumulation of propionate derivatives in the cytoplasm and plasma leads to intra- and extracellular metabolic acidosis. The clinical manifestation is severe; arrhythmia and cardiomyopathy (hypertrophic and dilated) are cited as major causes of death. Little is known of the underlying mechanisms. Since butyrate is in the same homologous series as propionate, and is itself a well-established inhibitor of histone deacetylases (HDACs), it is plausible pro-hypertrophic signalling in PA is epigenetically regulated. Therefore, we investigated the effects of propionate on cardiomyocytes. In preliminary work, culturing neonatal rat ventricular myocytes (NRVMs) in a chemical milieu mimicking PA (6 mM propionate; 200 M ammonium; 18 mM bicarbonate; pH 7.15) increased significantly cardiomyocyte area. Treating adult rat VMs with PA-medium increased significantly histone-3 lysine-9 acetylation, phenocopying the effects of butyrate. To determine the gene expression profile associated with PA, RNA-sequencing was performed on polyadenylated RNA extracted from NRVMs, treated with control-, butyrate-, or PA-medium. In PA-medium, Differentially Expressed Gene analysis demonstrated 3.0% of genes were upregulated and 3.0% downregulated (FDR<0.0001). Gene Ontology Enrichment Analysis using DAVID revealed ‘cardiac muscle contraction’ and ‘metabolic pathways’ as being significantly enriched. 1.9% of genes were upregulated in both PA and butyrate, representing candidates that could be regulated by HDACs. We are currently validating these hits.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».