A101 ARPC1B-DEFICIENT B CELLS DISPLAY ABERRANT SPREADING BEHAVIOUR
Notice bibliographique
Résumé
ARPC1B-deficiency is a newly described genetic condition with an early age of onset and is clinically similar to Wiskott-Aldrich syndrome (WAS). Nearly all affected patients experience colitis that is eosinophilic in nature, and their immunological profiles show increased peripheral CD19+ cells, IgE, IgA, and detectable auto-antibodies. ARPC1B is a member of the Arp2/3 actin nucleating complex, which is activated by WAS protein and is the rate-limiting step in branched actin polymerization. It is expressed by haematopoietic cells and is important for regulating a dynamic cytoskeleton for essential functions such as migration and intracellular transport. There are currently no data addressing the loss of ARPC1B and its effect on B cell function specifically. We intend to characterize how ARPC1B deficiency affects B cell activation in vitro. EBV-transformed lymphoblastoid (B cell) lines were generated from PBMCs derived from patients and their first-degree relatives. B cell receptor (BCR) internalization was assessed by flow cytometry. Cell spreading was activated by receptor cross-linking: B cells were added to anti-human IgG-coated chamber slides and allowed to spread (2–20 min), then fixed and stained with phalloidin which binds filamentous (F)-actin. Images were acquired and analysed in ImageJ. Our group identified three patients harbouring mutations in ARPC1B: one with a severe phenotype (Pat 1) accompanied by a homozygous 2 bp insertion (c.387_388insCT [L90fs]) resulting in truncation, and two brothers with mild (Pat 2)/very mild (Pat 3) phenotypes caused by 2 homozygous SNPs (c.434C>T [A105V]; c.832G>A [A238T]). In B cell lysates, immunoblots confirmed the loss of ARPC1B in Pat 1, and reduced protein in Pat 2/3 compared to controls; this pattern was inversely correlated with expression of its isoform, ARPC1A. Flow cytometric analysis of phalloidin-stained B cells showed significantly reduced F-actin in all affected patients, while BCR expression was higher (internalization was not affected). Interestingly, a small proportion of unstimulated B cells from Pat 1 spontaneously adhered to tissue culture-treated surfaces after 2 d. Moreover, spreading assays demonstrated that a higher number of B cells from Pat 1 stuck down with no effect on spreading area. Upon closer inspection, structured illumination microscopy of phalloidin-stained B cells revealed a divergent spreading phenotype, with fewer extensive protrusions in cells from Pat 1. B cells deficient in ARPC1B have an inherent defect affecting their activity in vivo, BCR expression, and spreading behaviour in vitro. Further characterization is warranted to define the mechanism underlying this phenotype and its implications in the development of early onset IBD. CAG, CIHRHelmsley Charitable Trust
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».