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Enregistrement W2794002159 · doi:10.1093/jcag/gwy009.082

A82 A BACH2 GENE VARIANT IS ASSOCIATED WITH POST-OPERATIVE RECURRENCE OF CROHN’S DISEASE

2018· article· en· W2794002159 sur OpenAlexafffund
Michael Laffin, Richard N. Fedorak, Eytan Wine, Bryan J. Dicken, Karen Madsen

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCrohn's diseaseDiseaseMedicineGenotypeCohortInternal medicineHazard ratioGastroenterologyUnivariate analysisMultivariate analysisBiologyGeneConfidence intervalGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Crohn’s disease often requires intestinal resection, which is not considered curative. Repeat surgical intervention is necessary in over half of the patients following their initial operation. Although many genetic loci are implicated in Crohn’s disease, few have been associated with post-resection recurrence. To identify genetic factors that predict recurrence of CD following intestinal resection. A cohort of Crohn’s disease subjects who underwent intestinal resection was analyzed to determine genetic and clinical factors associated with post-resection recurrence. Genotype was assessed at eight loci associated with adaptive immunity (SMAD3, IL10RB, IL15RA, BACH2, IL12B, IL18RAP, IFNGR2, and JAK2). Univariate and multivariate survival analyses were performed using a log-rank test and Cox-proportional hazard model, respectively. 191 Crohn’s disease subjects with 11.2 years mean post-operative follow-up were included. 46% experienced a surgical recurrence. Factors associated with increased incidence of recurrence included male gender(p=0.05), and shortened time to first intestinal surgery(5.0 vs 7.3years p=0.03), while inflammatory disease behaviour was associated with a lower chance of repeat surgery(p<0.01). Of the loci assessed on multivariate analysis, homozygosity for a risk allele at BACH2 (rs1847472) was significantly associated with disease recurrence(HR-1.24 CI-1.00–1.54 p<0.05). We identify BACH2 as a susceptibility locus for post-operative recurrence of Crohn’s disease in our cohort. BACH2 is critical in the differentiation and function of T-cells, as a regulator of B-cell activity, and is associated with several dysregulated immunologic phenomena. Its identification as a risk locus in post-operative Crohn’s disease recurrence suggests a potential role for regulatory T cells, effector T cells, humoral immunity, and immunologic memory in the development of this disease process. CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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