The major facilitator transporter Str3 is required for low-affinity heme acquisition in Schizosaccharomyces pombe
Notice bibliographique
Résumé
In the fission yeast Schizosaccharomyces pombe , acquisition of exogenous heme is largely mediated by the cell membrane–associated Shu1. Here, we report that Str3, a member of the major facilitator superfamily of transporters, promotes cellular heme import. Using a strain that cannot synthesize heme de novo ( hem1 Δ) and lacks Shu1, we found that the heme-dependent growth deficit of this strain is rescued by hemin supplementation in the presence of Str3. Microscopic analyses of a hem1 Δ shu1 Δ str3 Δ mutant strain in the presence of the heme analog zinc mesoporphyrin IX (ZnMP) revealed that ZnMP fails to accumulate within the mutant cells. In contrast, Str3-expressing hem1 Δ shu1 Δ cells could take up ZnMP at a 10-μm concentration. The yeast Saccharomyces cerevisiae cannot efficiently transport exogenously supplied hemin. However, heterologous expression of Str3 from S. pombe in S. cerevisiae resulted in ZnMP accumulation within S. cerevisiae cells. Moreover, hemin-agarose pulldown assays revealed that Str3 binds hemin. In contrast, an Str3 mutant in which Tyr and Ser residues of two putative heme-binding motifs ( 530 Y X 3 Y 534 and 552 S X 4 Y 557 ) had been replaced with alanines exhibited a loss of affinity for hemin. Furthermore, this Str3 mutant failed to rescue the heme-dependent growth deficit of a hem1 Δ shu1 Δ str3 Δ strain. Further analysis by absorbance spectroscopy disclosed that a predicted extracellular loop region in Str3 containing the two putative heme-binding motifs interacts with hemin, with a K D of 6.6 μm. Taken together, these results indicate that Str3 is a second cell-surface membrane protein for acquisition of exogenous heme in S. pombe .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».