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Enregistrement W2794076441 · doi:10.1111/jbg.12317

Comparing deregression methods for genomic prediction of test‐day traits in dairy cattle

2018· article· en· W2794076441 sur OpenAlex
Hinayah Rojas de Oliveira, Ferran Silva, Luiz F. Brito, A.R. Guarini, J. Jamrozik, Flávio S. Schenkel

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Breeding and Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensCanadian Animal Health InstituteUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaCanadian Dairy CommissionDairy Farmers of Canada
Mots-clésBest linear unbiased predictionBiologyGenomic selectionPopulationStatisticsLinear regressionDairy cattleAnimal scienceGeneticsSelection (genetic algorithm)MathematicsSingle-nucleotide polymorphismDemographyComputer scienceMachine learningGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary We aimed to investigate the performance of three deregression methods (VanRaden, VR ; Wiggans, WG ; and Garrick, GR ) of cows’ and bulls’ breeding values to be used as pseudophenotypes in the genomic evaluation of test‐day dairy production traits. Three scenarios were considered within each deregression method: (i) including only animals with reliability of estimated breeding value ( REL EBV ) higher than the average of parent reliability ( REL PA ) in the training and validation populations; (ii) including only animals with REL EBV higher than 0.50 in the training and REL EBV higher than REL PA in the validation population; and (iii) including only animals with REL EBV higher than 0.50 in both training and validation populations. Individual random regression coefficients of lactation curves were predicted using the genomic best linear unbiased prediction ( GBLUP ), considering either unweighted or weighted residual variances based on effective records contributions. In summary, VR and WG deregression methods seemed more appropriate for genomic prediction of test‐day traits without need for weighting in the genomic analysis, unless large differences in REL EBV between training population animals exist.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,748
Score d'incertitude au seuil0,357

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle