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Enregistrement W2794292421 · doi:10.3389/fimmu.2018.00309

Polymorphisms in Toll-Like Receptor 10 and Tuberculosis Susceptibility: Evidence from Three Independent Series

2018· article· en· W2794292421 sur OpenAlexaff
Yu Wang, Miaomiao Zhang, Weiwei Huang, Shouquan Wu, Ming-Gui Wang, Xiaoyan Tang, Andrew J. Sandford, Jian‐Qing He

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesSpecialized Research Fund for the Doctoral Program of Higher Education of ChinaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésTuberculosisToll-like receptorSeries (stratigraphy)MedicineImmunologyBiologyImmune systemInnate immune systemPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The toll-like receptor 2 (TLR2) mediated immune response is critical for host defense against Mycobacterium tuberculosis. There is evidence that TLR10, a TLR2 signaling modulator, may be involved in progression of tuberculosis (TB). Methods: Using a self-validating case–control design, we tested for an association between seven TLR10 polymorphisms and susceptibility to TB in three independent series with two distinct populations. Single nucleotide polymorphism (SNP) genotypes were determined by the SNPscanTM method. Three genetic models (additive, dominant, and recessive) as well as multiple-SNP score analyses were used to evaluate the risk of TB associated with the TLR10 SNPs. Results: By comparing TB patients with healthy controls, we observed two SNPs (rs11466617 and rs4129009) that were associated with decreased risk of TB in the Tibetan population, but did not in the Chinese Han population. Further analysis demonstrated that the rs11466617 CC genotype served as a protective factor against the progression of latent TB infection (LTBI) to active TB under the recessive model. None of the SNPs were significantly different in comparisons of TB uninfected people with LTBI individuals. Additionally, when the underlying four TB-associated loci were considered together in a multiple-SNP score analysis, we observed an allele dose-dependent decrease in TB risk in Tibetans. Conclusion: Variants of TLR10 may show an ethnic specificity on susceptibility to TB in Tibetan individuals. rs11466617 affected the susceptibility to progress from LTBI to active TB disease, but was not associated with the establishment of latent TB infection after Mycobacterium tuberculosis exposure. More studies are needed to verify this genetic epidemiological result and unravel the role of TLR10 SNPs in the pathogenesis of TB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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