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Enregistrement W2794322693 · doi:10.18203/2394-6040.ijcmph20180744

Predicting adverse drug reaction outcomes with machine learning

2018· article· en· W2794322693 sur OpenAlexaff
Andy W. Chen

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Community Medicine and Public Health · 2018
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacovigilance and Adverse Drug Reactions
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMachine learningMedical prescriptionDrug reactionComputer scienceArtificial intelligenceAdverse effectDrugPredictive modellingResource (disambiguation)MedicineData miningPharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Adverse drug reactions are a drug safety issue affecting more than two million people in the U.S. annually. The Food and Drug Administration (FDA) maintains a comprehensive database of adverse drug reactions reported known as FAERS (FDA adverse event reporting system), providing a valuable resource for studying factors associated with ADRs. The goal of the project is to build predictive models to predict the outcome given patient characteristics and drug usage. The results can be valuable for health care practitioners by offering new knowledge on adverse drug reactions which can be used to improve decision making related to drug prescriptions.Methods: In this paper I present and discuss results from machine learning models used to predict outcomes of ADRs. Machine learning models are a popular set of models for prediction. They have gained attention recently and have been used in a variety of fields. They can be trained on existing data and retrained when new data become available. The trained models are then used to make predictions.Results: I find that the supervised learning models are work similarly within groups, with accuracy between 65% and 75% for predicting deaths and 70% to 75% for predicting hospitalizations. Across groups the models predict hospitalizations better than deaths.Conclusions: The predictive models I built achieve good accuracy. The results can potentially be improved when more data become available in the future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,903
Score d'incertitude au seuil0,942

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,209
Tête enseignante GPT0,500
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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