P848 FXR -1G>T (rs56163822) predicts deleterious outcomes in Crohn’s disease
Notice bibliographique
Résumé
Crohn's disease (CD) pathogenesis is multi-factorial. Bile acids as well as the bile acid-activated nuclear receptor, farnesoid X receptor (FXR) regulate several processes, including intestinal epithelial integrity, that appear to be defective in CD and contribute to disease manifestation. In humans and mice, FXR deficiency appears to portend a more severe disease phenotype in the setting of a primary insult. The novel genetic variant FXR-1G>T may decrease FXR activity. The fibroblast growth factor (FGF) 19 is a downstream product of FXR activity and is thus used as a surrogate marker. We hypothesise that changes in the intestinal barrier regulated through alterations in FXR activity may contribute to a more severe CD phenotype including a more rapid progression to surgery. We aim to determine whether the FXR-1T variant allele is a predictor of disease severity in CD. Furthermore, we hope to suggest a molecular mechanism by which genetic variation in FXR may contribute to outcomes of severity in CD. The presence of the genetic variant FXR-1G>T was evaluated in 386 individuals with CD using real-time polymerase chain reaction (PCR) technique. FGF19 plasma concentrations were evaluated in a subset of CD individuals (n = 137) who underwent a CD-related intra-abdominal surgical intervention using an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). FXR-1G>T variant status and FGF19 plasma concentrations were evaluated in relation to one another as well as to important clinical outcomes related to CD severity including risk of and time to surgery, failure of drug therapy, number of flares and number of hospitalisations. There was a strong association between carriers of the variant T allele and surgical intervention (odds ratio, OR=2.80, 95% CI=1.16–6.72, p = 0.02). Moreover, FXR-1T variant carriers were more likely to go on to an early surgical intervention compared with wild-type individuals (5.99 years ± 6.94 vs. 1.56 years ± 2.08; hazard ratio, HR=5.433 (2.186–13.51), p < 0.001). FXR -1T remained an independent predictor of early progression to surgical intervention in CD in a multiple linear regression model adjusting for age, sex, weight, drug exposure and other surgical risk factors. FGF19 plasma concentrations were lower in FXR-1GT variant carriers, though this did not achieve statistical significance on univariate analysis or multivariate analysis (GG = 0.35 pg/l ± 0.04 pg/l; GT = 0.23 pg/l ± 0.05 pg/l , p = 0.094). Screening CD patients for FXR-1T variant carrier status may be useful for identifying patients at risk for early, poor outcomes. Carriers of the variant allele may benefit from earlier, more aggressive medical management.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».