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Enregistrement W2794450674 · doi:10.1101/288977

Cell-lineage specificity of primary cilia during epididymis post-natal development

2018· preprint· en· W2794450674 sur OpenAlexafffund
Agathe Bernet, Alexandre Bastien, Denis Soulet, Olivia Jerczynski, Christian Roy, Maíra Bianchi Rodrigues Alves, Cynthia Lecours, Marie‐Ève Tremblay, Janice L. Bailey, Claude Robert, Clémence Belleannée

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésCiliumCell biologyBiologyEpididymisWnt signaling pathwayOrganelleSignal transductionGeneticsSperm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Primary cilia are sensory organelles that orchestrate major signaling pathways during organ development and homeostasis. By using a double Arl13b/mCherry-Cetn2/GFP transgenic mouse model, we characterized the spatio-temporal localization of primary cilia in the epididymis, from birth to adulthood. We report here a constitutive localisation of primary cilia in peritubular myoid cells and a dynamic profiling in differentiated epithelial cells throughout post-natal development. While primary cilia are present at the apical pole of the undifferentiated epithelial cells from birth to puberty, they are absent from the apical pole of the epithelium in adults, where they appear exclusively associated with cytokeratin 5-positive basal cells. Exogenous labeling of primary cilia marker Arl13b and IFT88 confirmed the cell lineage specific localization of primary cilia in basal cells and myoid cells in human epididymides. From whole epididymis tissues and serum-free cultures of DC2 murine epididymal principal cell lines we determined that primary cilia from the epididymis are associated with the polycystic kidney disease-related proteins polycystin 1 (PC1) and polycystin 2 (PC2), and Gli3 Hedgehog signaling transcription factor. Thus, our findings unveil the existence of primary cilia sensory organelles, which have the potential to mediate mechano/ chemo-signaling events in the epididymis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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