Genome-wide identification and expression analysis of the <i>OSCA</i> gene family in <i>Pyrus bretschneideri</i>
Notice bibliographique
Résumé
Responses to osmotic change are critical for plant survival, development, and reproduction. Hyperosmolality-induced cytosolic free calcium concentration [(Ca2+)i] increase (OSCAs) proteins have been described as osmosensors in plants and animals. To investigate functional roles of OSCA genes (PbrOSCAs) in pear (Pyrus bretschneideri Rehd.), bioinformatics, and expression analyses of the PbrOSCAs were performed. Sixteen PbrOSCA members were identified in the pear genome. PbrOSCA family members were classified into four clades by sequence alignment and phylogenetic analysis. Moreover, protein structure analysis indicated that the 16 PbrOSCA members shared similar structures with their homologues in Arabidopsis and rice. Multi-transmembrane patterns and ion transport pore sites of PbrOSCAs were conserved, and expression profiles of PbrOSCA varied among tissues and with osmotic stress conditions. In particular, expression levels of six PbrOSCAs gradually increased with time during osmotic stress, suggesting that PbrOSCAs may play regulatory roles in plant osmotic stress responses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».