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Enregistrement W2794778229 · doi:10.1101/262634

Diet Modifies Colonic Microbiota and CD4 <sup>+</sup> T Cell Repertoire to Trigger Flares in a Novel Model of Colitis Induced by IL-23

2018· preprint· en· W2794778229 sur OpenAlexaff
Lili Chen, Zhengxiang He, Alina C. Iuga, Sebastião N. Martins Filho, Jeremiah J. Faith, José C. Clemente, Madhura Deshpande, Anitha D. Jayaprakash, Jean‐Frédéric Colombel, Juan J. Lafaille, Ravi Sachidanandam, Gláucia C. Furtado, Sérgio A. Lira

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueIL-33, ST2, and ILC Pathways
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunologyColitisBiologyInflammatory bowel diseasePopulationMesenteric lymph nodesContext (archaeology)Gut floraT cellUlcerative colitisDiseaseInternal medicineMedicineImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A wealth of experimental data points to immunological and environmental factors in the pathogenesis of inflammatory bowel disease (IBD). Here we study the role of IL-23, the microbiome, and the diet in the development of colitis. To promote IL-23 expression in vivo, we generated a mouse model in which IL-23 was conditionally expressed by CX 3 CR1 + myeloid cells, upon cyclic administration of tamoxifen in a specific diet (diet 2019). IL-23 expression induced an intestinal inflammatory disease that resembled ulcerative colitis in humans with cycles of acute disease and remission. The relapses were caused by the diet switch from the conventional diet used in our facility (diet 5053) to the diet 2019, and were not dependent on tamoxifen after the first cycle. The switch in the diet modified the microbiota, but did not alter the levels of IL-23. Colitis induction depended on the microbiota and required CD4 T lymphocytes. Colitis-inducing CD4 + T cells were found in the mesenteric lymph node and large intestine during remission and were able to trigger disease when transferred to lymphopenic mice, but only upon diet modification. The CD4 TCR repertoire in the diseased recipient Rag -/- mice had reduced diversity associated with the expansion of dominant T cell clones. These findings reveal a critical role for IL-23 in generation of a CD4 + T cell population in mice that is sensitive to a modification of intestinal bacterial flora subsequent to a dietary manipulation. Dietary changes occurring in the context of altered IL-23 expression may contribute to the onset and progression of IBD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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