2'-O-methylation of the mRNA cap protects RNAs from decapping and degradation by DXO
Notice bibliographique
Résumé
The 5' RNA cap structure (m7GpppRNA) is a key feature of eukaryotic mRNAs with important roles in stability, splicing, polyadenylation, mRNA export, and translation. Higher eukaryotes can further modify this minimal cap structure with the addition of a methyl group on the ribose 2'-O position of the first transcribed nucleotide (m7GpppNmpRNA) and sometimes on the adjoining nucleotide (m7GpppNmpNmpRNA). In higher eukaryotes, the DXO protein was previously shown to be responsible for both decapping and degradation of RNA transcripts harboring aberrant 5' ends such as pRNA, pppRNA, GpppRNA, and surprisingly, m7GpppRNA. It was proposed that the interaction of the cap binding complex with the methylated cap would prevent degradation of m7GpppRNAs by DXO. However, the critical role of the 2'-O-methylation found in higher eukaryotic cap structures was not previously addressed. In the present study, we demonstrate that DXO possesses both decapping and exoribonuclease activities toward incompletely capped RNAs, only sparing RNAs with a 2'-O-methylated cap structure. Fluorescence spectroscopy assays also revealed that the presence of the 2'-O-methylation on the cap structure drastically reduces the affinity of DXO for RNA. Moreover, immunofluorescence and structure-function assays also revealed that a nuclear localisation signal is located in the amino-terminus region of DXO. Overall, these results are consistent with a quality control mechanism in which DXO degrades incompletely capped RNAs.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».