Cell-based glycan arrays for probing glycan–glycan binding protein interactions
Notice bibliographique
Résumé
Glycan microarrays provide a high-throughput means of profiling the interactions of glycan-binding proteins with their ligands. However, the construction of current glycan microarray platforms is time consuming and expensive. Here, we report a fast and cost-effective method for the assembly of cell-based glycan arrays to probe glycan-glycan-binding protein interactions directly on the cell surface. Chinese hamster ovary cell mutants with a narrow and relatively homogeneous repertoire of glycoforms serve as the foundation platforms to develop these arrays. Using recombinant glycosyltransferases, sialic acid, fucose, and analogs thereof are installed on cell-surface glycans to form cell-based arrays displaying diverse glycan epitopes that can be probed with glycan-binding proteins by flow cytometry. Using this platform, high-affinity glycan ligands are discovered for Siglec-15-a sialic acid-binding lectin involved in osteoclast differentiation. Incubating human osteoprogenitor cells with cells displaying a high-affinity Siglec-15 ligand impairs osteoclast differentiation, demonstrating the utility of this cell-based glycan array technology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».