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Enregistrement W2795359826 · doi:10.4236/ajps.2018.94065

Metabolomics Profile of Potato Tubers after Phosphite Treatment

2018· article· en· W2795359826 sur OpenAlexafffund
Xingxi Gao, Steven Locke, Junzeng Zhang, Jyoti Joshi, Gefu Wang‐Pruski

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Plant Sciences · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePotato Plant Research
Établissements canadiensNational Research Council CanadaDalhousie University
Organismes subventionnairesDepartment of Agriculture, Nova Scotia
Mots-clésPhytophthora infestansMetabolomicsMetaboliteFungicideOomyceteMetabolomeBlightGas chromatography–mass spectrometryBiologyHorticultureMass spectrometryChemistryPathogenBiochemistryChromatographyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phosphite (Phi)-based fungicides are used to control the oomycete Phytophthora infestans which causes late blight disease, the most devastating disease in potatoes. In order to examine the effects of Phi-based fungicides on potato tubers through foliar or post-harvest application, a metabolite profiling approach based on gas chromatography coupled to mass spectrometry (GC-MS) has been established. A total of 132 metabolites were detected using the GC-MS approach. Among these, 34 metabolites were identified after normalization and annotated with a compound name with standard mass spectral library. Metabolomic analysis of Phi-treated plants showed significant differences in the levels of many metabolites especially amino acids. Multivariate statistical approaches, such as principal component analysis (PCA) and partial least squares discriminant analysis (PLS-DA), were employed to explore the relationships between metabolites to detect group differences. A good discrimination between the control and the Phi-treated plants was observed, which demonstrated that significant changes in the metabolite profile have been caused by the two different Phi applications (foliar or post-harvest). This finding suggests that the alteration of specific metabolite levels by accumulation of Phi can lead to resistance against the pathogen.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,398
Score d'incertitude au seuil0,524

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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